RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493945.5

ACTB-213, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,236 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-213ENST00000493945 J3QL48 77 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 TCL1BO95988 128 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 Q8NBF4 154 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.89□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.88□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.87□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 Q8N377 158 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.86□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 MOBPQ13875 183 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.85□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 A0A087X002 238 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-213ENST00000493945 UBE2V1Q13404 147 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 Q6JHZ5 121 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 C9JAW5 83 aa8.82□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.82□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.82□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 H3BT86 120 aa8.81□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 K7EP34 96 aa8.81□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 H3BMG7 143 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 SMIM29Q86T20 159 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 ABCA13Q86UQ4 5058 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 KRTAP10-8P60410 259 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-213ENST00000493945 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.77□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 SPINK1P00995 79 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 CD164Q04900 197 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 DSCR8Q96T75 97 aa8.75□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 LIMD2Q9BT23 127 aa8.74□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 MT1HL1P0DM35 61 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 PDE6GP18545 87 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 MYCBP2O75592 4640 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-213ENST00000493945 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 F8W1H4 67 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 IGFL1Q6UW32 110 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 A0A1B0GV72 72 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 TEN1Q86WV5 123 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 MTURNQ8N3F0 131 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 Q6Q795 121 aa8.66□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.65□□□□□ -1.02
ACTB-213ENST00000493945 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 CCKP06307 115 aa8.64□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 A0A1B0GW54 56 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 VPS25Q9BRG1 176 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 A0A1B0GV90 55 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 PRO0461Q9UI25 63 aa8.62□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 Q5XG85 94 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.61□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 TNXBP22105 4242 aa8.59□□□□□ -1.03
ACTB-213ENST00000493945 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 Q6ZQT0 140 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 A0A0G2JQZ4 141 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 A0A087WSZ3 146 aa8.56□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 A0A1W2PNM2 257 aa8.55□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 ETDBQ3ZM63 59 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.54□□□□□ -1.04
ACTB-213ENST00000493945 PRR4Q16378 134 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-213ENST00000493945 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-213ENST00000493945 J3QR89 54 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 J3KT08 172 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 NREPQ16612 68 aa8.45□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 C1orf195Q5TG92 126 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 UBL5Q9BZL1 73 aa8.44□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 ACYP1P07311 99 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 SIGMAR1Q99720 223 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-213ENST00000493945 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 IGKV4-1P06312 121 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 NDUFB1O75438 58 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 TPRXLQ17RH7 258 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 Q96NJ1 140 aa8.35□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 BPY2O14599 106 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 Q6ZVQ6 151 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 CDIP1Q9H305 208 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-213ENST00000493945 LINC00846Q9NV44 126 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-213ENST00000493945 HERC1Q15751 4861 aa8.32□□□□□ -1.08
ACTB-213ENST00000493945 A8MWP4 228 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-213ENST00000493945 C8orf87E5RJ46 101 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-213ENST00000493945 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.3□□□□□ -1.08
ACTB-213ENST00000493945 K7ERU9 68 aa8.29□□□□□ -1.08
ACTB-213ENST00000493945 A0A1B0GVX0 72 aa8.28□□□□□ -1.08
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