RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 HERC1Q15751 4861 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 C11orf86A6NJI1 115 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 A8MU10 97 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 REG3GQ6UW15 175 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa3.91□□□□□ -1.78
JMJD1C-208ENST00000490669 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa3.9□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 PSCAO43653 123 aa3.9□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP10-5P60370 271 aa3.9□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 ROMO1P60602 79 aa3.9□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 C20orf203Q8NBC4 194 aa3.9□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 HIGD1CA8MV81 97 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 IGLV2-11P01706 119 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 PRR4Q16378 134 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 MIAQ16674 131 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 CASC2Q6XLA1 102 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 WFDC10BQ8IUB3 73 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 LYPD1Q8N2G4 141 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 Q8NDZ9 215 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 PRO0255Q9UI72 69 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 SNURFQ9Y675 71 aa3.89□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-53P01767 116 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP10-1P60331 282 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 ICOSQ9Y6W8 199 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.88□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A087WTM6 91 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 DNAL4O96015 105 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 PRAC1Q96KF2 57 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A1B0GUV1 79 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 OCR1Q9BZK8 76 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 TMEM167BQ9NRX6 74 aa3.86□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 D6R8Y8 96 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 F8VRH5 84 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 CRPP02741 224 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 ARL14EPLP0DKL9 152 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 Q1RN00 199 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC00846Q9NV44 126 aa3.85□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 A6NED7 52 aa3.84□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 LUZP6Q538Z0 58 aa3.84□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 SMIM29Q86T20 159 aa3.84□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
JMJD1C-208ENST00000490669 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 K7ERS5 55 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 CRIP1P50238 77 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 Q6ZSA8 131 aa3.83□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 IGIPA6NJ69 53 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 LECT2O14960 151 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 HAMPP81172 84 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 Q5VSD8 79 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 C7orf33Q8WU49 177 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 C22orf24Q9Y442 160 aa3.82□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A1B0GUT8 65 aa3.81□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 A8MWP4 228 aa3.81□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 Q6ZQT0 140 aa3.81□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 Q86TA4 180 aa3.81□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.8□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa3.8□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A0J9YXY3 114 aa3.8□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 LELP1Q5T871 98 aa3.8□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A087WSZ3 146 aa3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 I3L3M4 83 aa3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 NREPQ16612 68 aa3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 LYZL1Q6UWQ5 148 aa3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 Q9BRP9 147 aa3.79□□□□□ -1.8
JMJD1C-208ENST00000490669 PRR15LQ9BU68 103 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.3 ms