RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487774.1

C7orf49-211, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C7orf49, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf49-211ENST00000487774 A4D1N5 150 aa9.22□□□□□ -0.93
C7orf49-211ENST00000487774 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
C7orf49-211ENST00000487774 FABP4P15090 132 aa9.21□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.21□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 YPEL4Q96NS1 127 aa9.2□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 A6NDN8 102 aa9.18□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.17□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.17□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.17□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 ZNF815PA8K554 130 aa9.16□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 DSCR10P59022 87 aa9.15□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.15□□□□□ -0.94
C7orf49-211ENST00000487774 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa9.14□□□□□ -0.95
C7orf49-211ENST00000487774 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.14□□□□□ -0.95
C7orf49-211ENST00000487774 Q6ZQY7 126 aa9.12□□□□□ -0.95
C7orf49-211ENST00000487774 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
C7orf49-211ENST00000487774 LINC00575Q6W349 94 aa9.1□□□□□ -0.95
C7orf49-211ENST00000487774 H3BUT2 72 aa9.07□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 APOC3P02656 99 aa9.07□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 Q6ZVH6 145 aa9.07□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.07□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 TRGC2P03986 189 aa9.06□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 A8MWP4 228 aa9.05□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 IFITM1P13164 125 aa9.05□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 hADV29S1A0JD25 119 aa9.04□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 SNAPINO95295 136 aa9.03□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.03□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 COPS9Q8WXC6 57 aa9.03□□□□□ -0.96
C7orf49-211ENST00000487774 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.02□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.02□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MDN1Q9NU22 5596 aa9.01□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.01□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SVBPQ8N300 66 aa9.01□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 VAMP3Q15836 100 aa9□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 MTURNQ8N3F0 131 aa9□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 LINC00313P59037 77 aa8.99□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 LINC01545Q5VT33 79 aa8.98□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 A0A087WSZ3 146 aa8.97□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 COLCA2A8K830 154 aa8.97□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.97□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 KMT2DO14686 5537 aa8.96□□□□□ -0.97
C7orf49-211ENST00000487774 SCGB1D1O95968 90 aa8.96□□□□□ -0.98
C7orf49-211ENST00000487774 PPDPFLQ8WWR9 84 aa8.96□□□□□ -0.98
C7orf49-211ENST00000487774 TEN1Q86WV5 123 aa8.95□□□□□ -0.98
C7orf49-211ENST00000487774 SIGMAR1Q99720 223 aa8.95□□□□□ -0.98
C7orf49-211ENST00000487774 NDUFA5Q16718 116 aa8.93□□□□□ -0.98
C7orf49-211ENST00000487774 KRTAP5-9P26371 169 aa8.9□□□□□ -0.98
C7orf49-211ENST00000487774 PET117Q6UWS5 81 aa8.89□□□□□ -0.99
C7orf49-211ENST00000487774 A6NN06 94 aa8.86□□□□□ -0.99
C7orf49-211ENST00000487774 SPINK7P58062 85 aa8.85□□□□□ -0.99
C7orf49-211ENST00000487774 IGKV4-1P06312 121 aa8.84□□□□□ -0.99
C7orf49-211ENST00000487774 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.82□□□□□ -1
C7orf49-211ENST00000487774 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.82□□□□□ -1
C7orf49-211ENST00000487774 C3orf79P0CE67 100 aa8.8□□□□□ -1
C7orf49-211ENST00000487774 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
C7orf49-211ENST00000487774 A0A1W2PNM2 257 aa8.78□□□□□ -1
C7orf49-211ENST00000487774 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.77□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.76□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.76□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.75□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 C12orf57Q99622 126 aa8.74□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 H3BMG7 143 aa8.73□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 ATOH7Q8N100 152 aa8.73□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 GHRHP01286 108 aa8.72□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 MT1BP07438 61 aa8.72□□□□□ -1.01
C7orf49-211ENST00000487774 KRTDAPP60985 99 aa8.71□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.71□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 FAM218AQ96MZ4 157 aa8.7□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BKO60814 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BJP06899 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BOP23527 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BBP33778 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BDP58876 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BCP62807 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.68□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 KRTAP10-5P60370 271 aa8.65□□□□□ -1.02
C7orf49-211ENST00000487774 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 C8orf87E5RJ46 101 aa8.64□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 A0A1B0GVX0 72 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 RAB37Q96AX2 223 aa8.62□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 FABP2P12104 132 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.6□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 Q5VV11 94 aa8.59□□□□□ -1.03
C7orf49-211ENST00000487774 SNCGO76070 127 aa8.57□□□□□ -1.04
C7orf49-211ENST00000487774 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-211ENST00000487774 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.56□□□□□ -1.04
C7orf49-211ENST00000487774 H0YGX0 51 aa8.55□□□□□ -1.04
C7orf49-211ENST00000487774 A0A1B0GV72 72 aa8.52□□□□□ -1.05
C7orf49-211ENST00000487774 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
C7orf49-211ENST00000487774 TRACP01848 142 aa8.49□□□□□ -1.05
C7orf49-211ENST00000487774 SPRR2EP22531 72 aa8.49□□□□□ -1.05
C7orf49-211ENST00000487774 SPRR2BP35325 72 aa8.49□□□□□ -1.05
C7orf49-211ENST00000487774 SPRR2AP35326 72 aa8.49□□□□□ -1.05
C7orf49-211ENST00000487774 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms