RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485499.1

PTPRT-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRT, Length 208 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-208ENST00000485499 J3QQQ9 107 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 ERC2-IT1O76042 136 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 DPM2O94777 84 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 NMUP48645 174 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 Q1RN00 199 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 Q6ZRX8 168 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.14□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 C9orf92A6NGG3 77 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 SERF1AO75920 110 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 IGKCP01834 107 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 SLC25A34Q6PIV7 304 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 Q6Q795 121 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 PMCHL2Q9BQD1 86 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 Q9BRP9 147 aa3.13□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 NDUFC2O95298 119 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 TRGC2P03986 189 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 LIMD2Q9BT23 127 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 IGLV6-57P01721 117 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 TAL2Q16559 108 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.11□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 A0A0J9YXY3 114 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP5-8O75690 187 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 MT2AP02795 61 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 YPEL4Q96NS1 127 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.1□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 MT1FP04733 61 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 COX7BP24311 80 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 SPANXCQ9NY87 97 aa3.09□□□□□ -1.91
PTPRT-208ENST00000485499 ZNF815PA8K554 130 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 E9PLD3 99 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 H7C2G1 150 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.08□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP12-2P59991 146 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 COPS9Q8WXC6 57 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 PRO1933Q9H354 126 aa3.07□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 A6NDN8 102 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 TIMM17BO60830 172 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 AKR1D1P51857 326 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP10-10P60014 251 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 C6orf99Q4VX62 202 aa3.06□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 SPRR1BP22528 89 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 CD164Q04900 197 aa3.05□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 A0A1B0GWB2 263 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 C20orf202A1L168 122 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 COLCA2A8K830 154 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 F8WEM9 126 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 KRTDAPP60985 99 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 TCL1BO95988 128 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 LINC01545Q5VT33 79 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 TTTY13Q9BZ97 58 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRT-208ENST00000485499 A0A0G2JQZ4 141 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 A4D1N5 150 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 IFITM1P13164 125 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 VAMP3Q15836 100 aa3.02□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BKO60814 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BJP06899 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 C3orf79P0CE67 100 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BOP23527 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BBP33778 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BDP58876 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BCP62807 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST2H2BEQ16778 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 C1orf195Q5TG92 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 PCP2Q8IVA1 136 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 MUSTN1Q8IVN3 82 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BHQ93079 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BNQ99877 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 HIST1H2BMQ99879 126 aa3.01□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 Q6ZVH6 145 aa3□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 ATOH7Q8N100 152 aa3□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.99□□□□□ -1.93
PTPRT-208ENST00000485499 Q5XG85 94 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44 ms