RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477144.1

HOXB-AS3-209, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB-AS3, Length 743 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CDIP1Q9H305 208 aa8.54□□□□□ -1.04
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C1orf137Q5JT78 98 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00643Q86TS7 51 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXB-AS3-209ENST00000477144 UBL5Q9BZL1 73 aa8.53□□□□□ -1.04
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ERC2-IT1O76042 136 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q6ZSA8 131 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.52□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPRR1BP22528 89 aa8.51□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ZNF861PO60384 105 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.5□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q6JHZ5 121 aa8.49□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP10-1P60331 282 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCXQ7RTU7 201 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q8N1X5 172 aa8.48□□□□□ -1.05
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGLV7-43P04211 117 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SCGB1A1P11684 91 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 XGP55808 180 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IMUPQ9GZP8 106 aa8.46□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00846Q9NV44 126 aa8.45□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.44□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMIM29Q86T20 159 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C3orf22Q8N5N4 141 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPRR4Q96PI1 79 aa8.43□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MT-ATP8P03928 68 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q6Q795 121 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q8NBF4 154 aa8.42□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00483Q53H64 154 aa8.41□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NREPQ16612 68 aa8.4□□□□□ -1.06
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CRYGAP11844 174 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q6ZVQ6 151 aa8.37□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CXCL6P80162 114 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HAMPP81172 84 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGFL1Q6UW32 110 aa8.36□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAT1Q14517 4588 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A1W2PNM2 257 aa8.34□□□□□ -1.07
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.33□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q5VSD8 79 aa8.32□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 BPY2O14599 106 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.31□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.3□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HERC1Q15751 4861 aa8.29□□□□□ -1.08
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MOBPQ13875 183 aa8.27□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A087WSZ3 146 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM229AH3BQW9 127 aa8.26□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PCP4P48539 62 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 CD164Q04900 197 aa8.25□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 J3KT08 172 aa8.24□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.22□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ATOX1O00244 68 aa8.21□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 MYCBP2O75592 4640 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.2□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.18□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A0G2JQZ4 141 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 NDUFB1O75438 58 aa8.17□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 J3QL48 77 aa8.16□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HRCT1Q6UXD1 115 aa8.15□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A087WVE0 104 aa8.14□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LIMD2Q9BT23 127 aa8.14□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 IGKV4-1P06312 121 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A8MWP4 228 aa8.11□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.11□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 A0A087X002 238 aa8.1□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.1□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 DSCR10P59022 87 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q5XG85 94 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXB-AS3-209ENST00000477144 SPINK1P00995 79 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 PRR15Q8IV56 129 aa8.07□□□□□ -1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 Q8N9L7 120 aa8.07□□□□□ -1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 HCG22E2RYF7 251 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXB-AS3-209ENST00000477144 K7EQZ3 153 aa8.06□□□□□ -1.12
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