RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450375.5

PARL-208, Transcript of presenilin associated rhomboid like, human

TSL 2

Gene PARL, Length 488 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PARL-208	ENST00000450375	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PARL-208	ENST00000450375	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PARL-208	ENST00000450375	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PARL-208	ENST00000450375		Q1RN00	199 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PARL-208	ENST00000450375	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PARL-208	ENST00000450375		A4D1N5	150 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375		H3BS24	57 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	PRO1933	Q9H354	126 aa		5.07	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	SCGB1D1	O95968	90 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	VAMP3	Q15836	100 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375		H7C2G1	150 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	CD164	Q04900	197 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375		F8WEM9	126 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	HIST1H4G	Q99525	98 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PARL-208	ENST00000450375	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	SMIM29	Q86T20	159 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	hADV29S1	A0JD25	119 aa		5	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	COX8A	P10176	69 aa		5	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	LINC00575	Q6W349	94 aa		5	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	C12orf57	Q99622	126 aa		5	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375		Q6ZQY7	126 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	TCL1B	O95988	128 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375		Q5XG85	94 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	DLEU1	O43261	78 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PARL-208	ENST00000450375	SNCG	O76070	127 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375		Q6JHZ5	121 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	CFC1	P0CG37	223 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375		A0A0B4J2C4	111 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375		H0YGX0	51 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PARL-208	ENST00000450375		H3BUT2	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	CEND1	Q8N111	149 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	LST1	O00453	97 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375		A0A1B0GX51	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	FABP2	P12104	132 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	FXYD2	P54710	66 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375		H3BMG7	143 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	DNAL4	O96015	105 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	PSMB2	P49721	201 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	HSD52	Q0P140	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PARL-208	ENST00000450375	TRIAP1	O43715	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		Q6Q795	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	COX6C	P09669	75 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		A0A087WSZ3	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		H3BQ85	93 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		K7ERJ3	54 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		Q75L30	129 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		Q96NJ1	140 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		A0A1B0GV72	72 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.79	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	MT1H	P80294	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375	SIGMAR1	Q99720	223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
PARL-208	ENST00000450375		A0A1W2PNM2	257 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARL-208	ENST00000450375		M0R2T5	61 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PARL-208	ENST00000450375	SCGB1C2	P0DMR2	95 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.7 ms