RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.44□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf137Q5JT78 98 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8NBF4 154 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMK2N2Q96S95 79 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB4AO15263 64 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 KCNQ1DNQ9H478 68 aa5.4□□□□□ -1.54
RABGEF1-203ENST00000439720 ACANP16112 2415 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A0G2JQZ4 141 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GW54 56 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1W2PNN7 141 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.39□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 H0Y9P7 68 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 Q9BRP9 147 aa5.38□□□□□ -1.55
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RABGEF1-203ENST00000439720 MOBPQ13875 183 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 C7orf33Q8WU49 177 aa5.38□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR4Q96PI1 79 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 HTN3P15516 51 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 COA5Q86WW8 74 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 PRAC1Q96KF2 57 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR34Q9NV39 138 aa5.37□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 NOTCH2Q04721 2471 aa5.36□□□□□ -1.55
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RABGEF1-203ENST00000439720 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP10-11P60412 298 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 K7EIL1 84 aa5.35□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 LELP1Q5T871 98 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.34□□□□□ -1.55
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZRX8 168 aa5.34□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.33□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BNG1 76 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 SPINK7P58062 85 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 C15orf56Q8N910 161 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.32□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 DEFB135Q30KP9 77 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 CASC2Q6XLA1 102 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A087WSZ3 146 aa5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 PCOTHQ58A44 107 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 MTORP42345 2549 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 H3BPC8 53 aa5.3□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 Q8NAQ8 132 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM168BA1KXE4 195 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFL1Q6UW32 110 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.29□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 CHTF8P0CG12 524 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa5.28□□□□□ -1.56
RABGEF1-203ENST00000439720 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.28□□□□□ -1.56
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.26□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 SPRR1AP35321 89 aa5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.24□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.22□□□□□ -1.57
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RABGEF1-203ENST00000439720 VWFP04275 2813 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.22□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.21□□□□□ -1.57
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MWP4 228 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.21□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 HRES1P13985 223 aa5.21□□□□□ -1.58
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RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.17□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 TENM2Q9NT68 2774 aa5.17□□□□□ -1.58
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RABGEF1-203ENST00000439720 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 LUZP6Q538Z0 58 aa5.16□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A096LNI7 61 aa5.15□□□□□ -1.58
RABGEF1-203ENST00000439720 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.15□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.14□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 CASC10Q5T4H9 136 aa5.13□□□□□ -1.59
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