RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q8N9L7 120 aa11.64□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 J3KT08 172 aa11.63□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV4-1P06312 121 aa11.63□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.63□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPS28P62857 69 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DPH3Q96FX2 82 aa11.61□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGFL1Q6UW32 110 aa11.61□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.6□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UBE2AP49459 152 aa11.6□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0G2JQZ4 141 aa11.59□□□□□ -0.55
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPRR1BP22528 89 aa11.58□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RTL8CO15255 209 aa11.56□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLKP1Q107X0 134 aa11.56□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.56□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KMT2AQ03164 3969 aa11.55□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH2Q9P225 4427 aa11.53□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H7BZZ5 65 aa11.53□□□□□ -0.56
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa11.5□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.5□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSCR10P59022 87 aa11.5□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNURFQ9Y675 71 aa11.5□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FBN3Q75N90 2809 aa11.49□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa11.48□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM236CP0DP71 79 aa11.48□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH17Q9UFH2 4485 aa11.48□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WSZ3 146 aa11.48□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SVIPQ8NHG7 77 aa11.48□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OCR1Q9BZK8 76 aa11.48□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TGP01266 2768 aa11.47□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LY6G6CO95867 125 aa11.47□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OXTP01178 125 aa11.47□□□□□ -0.57
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.45□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLAC8Q9NZF1 115 aa11.45□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 K7EQZ3 153 aa11.44□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFC1O43677 76 aa11.43□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM254Q8TBM7 123 aa11.43□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa11.42□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.4□□□□□ -0.58
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0U1RQV1 116 aa11.37□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00483Q53H64 154 aa11.37□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERP1Q9Y6X1 66 aa11.36□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa11.35□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH6Q9C0G6 4158 aa11.35□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH8Q96JB1 4490 aa11.34□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.34□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa11.34□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM30AQ9NZY2 134 aa11.34□□□□□ -0.59
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HCG22E2RYF7 251 aa11.33□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF861PO60384 105 aa11.32□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LCE6AA0A183 80 aa11.32□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.31□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP10-2P60368 255 aa11.28□□□□□ -0.6
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q5XG85 94 aa11.26□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALMS1Q8TCU4 4167 aa11.26□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FRAS1Q86XX4 4008 aa11.25□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A8MWP4 228 aa11.24□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WFDC13Q8IUB5 93 aa11.24□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRR15Q8IV56 129 aa11.24□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.24□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV7-43P04211 117 aa11.23□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MOBPQ13875 183 aa11.23□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa11.22□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH11Q96DT5 4516 aa11.22□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH5Q8TE73 4624 aa11.21□□□□□ -0.61
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.2□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q96NJ1 140 aa11.19□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf26Q17RF5 130 aa11.18□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf47Q569G3 176 aa11.18□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CASC2Q6XLA1 102 aa11.16□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMIM26A0A096LP01 95 aa11.15□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZSA8 131 aa11.15□□□□□ -0.62
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HYDINQ4G0P3 5121 aa11.15□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PKD1P98161 4303 aa11.14□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP10-1P60331 282 aa11.13□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NDUFB1O75438 58 aa11.12□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAT2Q9NYQ8 4349 aa11.12□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa11.11□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
NUP50-AS1-201ENST00000426282 hDV103S1A0JD37 113 aa11.04□□□□□ -0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MP68P56378 58 aa11.04□□□□□ -0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.04□□□□□ -0.64
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.02□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GVX0 72 aa11.01□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.01□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CD164Q04900 197 aa11□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H0Y9P7 68 aa10.99□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDK2AP2O75956 126 aa10.99□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.99□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.99□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BPC8 53 aa10.99□□□□□ -0.65
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00208Q96KT6 92 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.6 ms