RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERF1AO75920 110 aa8.02□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MTURNQ8N3F0 131 aa8.02□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NDN8 102 aa8.01□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.01□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 OCIAD2Q56VL3 154 aa8.01□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZVH6 145 aa8.01□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa8.01□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.01□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUC12Q9UKN1 5478 aa8□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A8MWP4 228 aa7.99□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COPS9Q8WXC6 57 aa7.98□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FABP4P15090 132 aa7.97□□□□□ -1.13
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.96□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DSCR10P59022 87 aa7.95□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VAMP3Q15836 100 aa7.94□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q6ZQY7 126 aa7.94□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.93□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB1D1O95968 90 aa7.92□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00575Q6W349 94 aa7.92□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IFITM1P13164 125 aa7.91□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 hADV29S1A0JD25 119 aa7.9□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00310P59036 64 aa7.9□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.9□□□□□ -1.14
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.89□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00313P59037 77 aa7.88□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.87□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.87□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.87□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNAPINO95295 136 aa7.86□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 YPEL4Q96NS1 127 aa7.86□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BUT2 72 aa7.85□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TEN1Q86WV5 123 aa7.85□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 APOC3P02656 99 aa7.84□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COLCA2A8K830 154 aa7.83□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.83□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SIGMAR1Q99720 223 aa7.83□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SVBPQ8N300 66 aa7.82□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WSZ3 146 aa7.81□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.81□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRGC2P03986 189 aa7.81□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFA5Q16718 116 aa7.8□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A6NN06 94 aa7.79□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP5-9P26371 169 aa7.78□□□□□ -1.16
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.77□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC01545Q5VT33 79 aa7.77□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.77□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 GHRHP01286 108 aa7.76□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPINK7P58062 85 aa7.73□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PET117Q6UWS5 81 aa7.73□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MDN1Q9NU22 5596 aa7.73□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGKV4-1P06312 121 aa7.72□□□□□ -1.17
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C12orf57Q99622 126 aa7.71□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KMT2DO14686 5537 aa7.7□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.7□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.66□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.65□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.65□□□□□ -1.18
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1W2PNM2 257 aa7.64□□□□□ -1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNCGO76070 127 aa7.63□□□□□ -1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H3BMG7 143 aa7.62□□□□□ -1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C3orf79P0CE67 100 aa7.62□□□□□ -1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C8orf87E5RJ46 101 aa7.6□□□□□ -1.19
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.58□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.56□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 Q5VV11 94 aa7.56□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RAB37Q96AX2 223 aa7.56□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.56□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MT1BP07438 61 aa7.55□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP10-5P60370 271 aa7.55□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.55□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTDAPP60985 99 aa7.54□□□□□ -1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A1B0GVX0 72 aa7.52□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FABP2P12104 132 aa7.51□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YGX0 51 aa7.5□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ATOH7Q8N100 152 aa7.5□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.5□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.49□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.49□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BKO60814 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BJP06899 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BOP23527 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BBP33778 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BDP58876 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BCP62807 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.47□□□□□ -1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.46□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.46□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DSCR8Q96T75 97 aa7.45□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TRACP01848 142 aa7.44□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR2EP22531 72 aa7.44□□□□□ -1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SPRR2BP35325 72 aa7.44□□□□□ -1.22
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