RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417284.1

RGPD4-AS1-201, Transcript of RGPD4 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 2

Gene RGPD4-AS1, Length 461 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 REG3GQ6UW15 175 aa3.42□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.42□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q9BRP9 147 aa3.42□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STAB2Q8WWQ8 2551 aa3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFC1O43677 76 aa3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPRR1BP22528 89 aa3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q8NBF4 154 aa3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.41□□□□□ -1.86
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A087WVE0 104 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PSCAO43653 123 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HAMPP81172 84 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KLKP1Q107X0 134 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1orf137Q5JT78 98 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CASC10Q5T4H9 136 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.4□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.39□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.39□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 BPY2O14599 106 aa3.39□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.39□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A096LNI7 61 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM168BA1KXE4 195 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 F8WEM9 126 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 M0R2N4 97 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SMIM29Q86T20 159 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SS18L2Q9UHA2 77 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LYSTQ99698 3801 aa3.38□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A1W2PNM2 257 aa3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGKV4-1P06312 121 aa3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE2BP63146 152 aa3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH2Q9P225 4427 aa3.37□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.36□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LCE6AA0A183 80 aa3.36□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A1W2PNN7 141 aa3.36□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 J3KT08 172 aa3.36□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.35□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.35□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.35□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 OCR1Q9BZK8 76 aa3.35□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.34□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H7BZZ5 65 aa3.34□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 Q6ZR54 194 aa3.34□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.34□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SPACA4Q8TDM5 124 aa3.34□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DPH3Q96FX2 82 aa3.34□□□□□ -1.87
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 COL7A1Q02388 2944 aa3.33□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00483Q53H64 154 aa3.33□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGFL1Q6UW32 110 aa3.33□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C20orf197Q8N268 126 aa3.33□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C3orf84H3BNL1 204 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 UBE2AP49459 152 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DSCR10P59022 87 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C5orf47Q569G3 176 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.32□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.31□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A087WTM6 91 aa3.31□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A0U1RQV1 116 aa3.31□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 H3BPC8 53 aa3.31□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.31□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.31□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 HCG22E2RYF7 251 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 FAM236CP0DP71 79 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRLHP81277 87 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LCE1EQ5T753 118 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SVIPQ8NHG7 77 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.3□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 NDUFB1O75438 58 aa3.29□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 PRR15Q8IV56 129 aa3.29□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.29□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 KMT2AQ03164 3969 aa3.29□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.29□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A0A087WSZ3 146 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 A8MWP4 228 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZNF861PO60384 105 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 C1orf134Q5TEV5 83 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 SCXQ7RTU7 201 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.28□□□□□ -1.88
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 TENM2Q9NT68 2774 aa3.27□□□□□ -1.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 K7EQZ3 153 aa3.27□□□□□ -1.89
RGPD4-AS1-201ENST00000417284 RTL8CO15255 209 aa3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.7 ms