RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PNM2 257 aa6.96□□□□□ -1.29
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSAG1Q6PB30 78 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.95□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.92□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 TENM3Q9P273 2699 aa6.92□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 F8P00451 2351 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCOTHQ58A44 107 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8N377 158 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3C-201ENST00000361441 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 C1orf137Q5JT78 98 aa6.9□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZR54 194 aa6.9□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RTL8CO15255 209 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 C7orf33Q8WU49 177 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q8NBF4 154 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 INAFM1C9JVW0 142 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 LELP1Q5T871 98 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A0G2JQZ4 141 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1W2PNN7 141 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOTCH1P46531 2555 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BPC8 53 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3QKU1 62 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 MAST4O15021 2626 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GW54 56 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRR34Q9NV39 138 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 STAB1Q9NY15 2570 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR4Q96PI1 79 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 ANK2Q01484 3957 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.81□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 HRES1P13985 223 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 C15orf56Q8N910 161 aa6.79□□□□□ -1.32
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAM168BA1KXE4 195 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 ROMO1P60602 79 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNP2Q05952 138 aa6.77□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 J3QL48 77 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL6A5A8TX70 2615 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.76□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.75□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 CASC10Q5T4H9 136 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087WSZ3 146 aa6.74□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.72□□□□□ -1.33
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-11P60412 298 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 REG3GQ6UW15 175 aa6.71□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.7□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A087X002 238 aa6.69□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.68□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 LYSTQ99698 3801 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.67□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGFL1Q6UW32 110 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q6ZRX8 168 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.66□□□□□ -1.34
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GU69 56 aa6.65□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 P0C880 135 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.64□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 A8MWP4 228 aa6.63□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 TENM2Q9NT68 2774 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 ZNF861PO60384 105 aa6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.61□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 CDK2AP2O75956 126 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRLHP81277 87 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 COL7A1Q02388 2944 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 UQCR11O14957 56 aa6.6□□□□□ -1.35
APOBEC3C-201ENST00000361441 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.58□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A096LNI7 61 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.57□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 MGAM2Q2M2H8 2515 aa6.56□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 H3BNG1 76 aa6.55□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.54□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 CHTF8P0CG12 524 aa6.53□□□□□ -1.36
APOBEC3C-201ENST00000361441 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.53□□□□□ -1.36
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