RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284957.9

RABGEF1-201, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-201ENST00000284957 RYR2Q92736 4967 aa5.84□□□□□ -1.47
RABGEF1-201ENST00000284957 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.48
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RABGEF1-201ENST00000284957 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.83□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
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RABGEF1-201ENST00000284957 PKHD1P08F94 4074 aa5.82□□□□□ -1.48
RABGEF1-201ENST00000284957 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
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RABGEF1-201ENST00000284957 A8MU10 97 aa5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.51□□□□□ -1.53
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RABGEF1-201ENST00000284957 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGEF1-201ENST00000284957 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.5□□□□□ -1.53
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