RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 BCE1O60756 84 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 VPREB1P12018 145 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 COX7CP15954 63 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 SYCNQ0VAF6 134 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 ESRGQ1W209 222 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.6□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.59□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP10-1P60331 282 aa4.59□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZQT0 140 aa4.59□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZQY7 126 aa4.59□□□□□ -1.67
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SMARCE1-201ENST00000264640 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.59□□□□□ -1.67
SMARCE1-201ENST00000264640 C15orf56Q8N910 161 aa4.59□□□□□ -1.67
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SMARCE1-201ENST00000264640 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 SERP2Q8N6R1 65 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.58□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.58□□□□□ -1.68
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SMARCE1-201ENST00000264640 Q8NDZ9 215 aa4.57□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 USP17L23D6RBM5 183 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 CRYGAP11844 174 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.56□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A1B0GW54 56 aa4.55□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 PRYO14603 147 aa4.55□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 CXCL6P80162 114 aa4.55□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.55□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.55□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.54□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.54□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.54□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.54□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZRP5 223 aa4.54□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 UPK3BQ9BT76 320 aa4.54□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM258P61165 79 aa4.52□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 C14orf177Q52M58 125 aa4.52□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZVQ6 151 aa4.52□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.51□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WVE0 104 aa4.51□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf33Q8WU49 177 aa4.51□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.51□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 NREPQ16612 68 aa4.5□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.5□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 A0A087WTM6 91 aa4.49□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 J3KT08 172 aa4.49□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 LRP2P98164 4655 aa4.49□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 F8WEM9 126 aa4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 PSCAO43653 123 aa4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 Q6ZRX8 168 aa4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.48□□□□□ -1.69
SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.47□□□□□ -1.69
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SMARCE1-201ENST00000264640 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 BPY2O14599 106 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 NDUFC1O43677 76 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 UBE2BP63146 152 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 REG3GQ6UW15 175 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8N377 158 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.46□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.45□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.45□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 ERC2-IT1O76042 136 aa4.45□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 OXTP01178 125 aa4.44□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf137Q5JT78 98 aa4.44□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.44□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 C20orf197Q8N268 126 aa4.43□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 Q8NBF4 154 aa4.43□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.43□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 KLKP1Q107X0 134 aa4.42□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 SCXQ7RTU7 201 aa4.42□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 Q9BRP9 147 aa4.42□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.41□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM168BA1KXE4 195 aa4.41□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM236CP0DP71 79 aa4.41□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 DPH3Q96FX2 82 aa4.41□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRR4Q96PI1 79 aa4.41□□□□□ -1.7
SMARCE1-201ENST00000264640 IGKV4-1P06312 121 aa4.4□□□□□ -1.71
SMARCE1-201ENST00000264640 TNXBP22105 4242 aa4.39□□□□□ -1.71
SMARCE1-201ENST00000264640 H0Y9J4 135 aa4.39□□□□□ -1.71
SMARCE1-201ENST00000264640 SVIPQ8NHG7 77 aa4.39□□□□□ -1.71
SMARCE1-201ENST00000264640 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.39□□□□□ -1.71
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