RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263012.10

NOMO3-201, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 3,911 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-201ENST00000263012 C14orf177Q52M58 125 aa11.49□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 EPM2AB3EWF7 344 aa11.48□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 BCE1O60756 84 aa11.48□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.47□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 TENM3Q9P273 2699 aa11.47□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa11.47□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 IGFL1Q6UW32 110 aa11.47□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 OTOGQ6ZRI0 2925 aa11.46□□□□□ -0.57
NOMO3-201ENST00000263012 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.46□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.46□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 TENM4Q6N022 2769 aa11.45□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 DNAH10OSP0CZ25 163 aa11.44□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 MOBPQ13875 183 aa11.42□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 SPINK1P00995 79 aa11.41□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 OCR1Q9BZK8 76 aa11.4□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 hDV103S1A0JD37 113 aa11.4□□□□□ -0.58
NOMO3-201ENST00000263012 SEC61GP60059 68 aa11.4□□□□□ -0.59
NOMO3-201ENST00000263012 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
NOMO3-201ENST00000263012 LY6G6CO95867 125 aa11.38□□□□□ -0.59
NOMO3-201ENST00000263012 TRAV22A0A0B4J277 110 aa11.37□□□□□ -0.59
NOMO3-201ENST00000263012 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.34□□□□□ -0.59
NOMO3-201ENST00000263012 DSCR10P59022 87 aa11.34□□□□□ -0.59
NOMO3-201ENST00000263012 H3BNG1 76 aa11.33□□□□□ -0.6
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.31□□□□□ -0.6
NOMO3-201ENST00000263012 C16orf90A8MZG2 172 aa11.29□□□□□ -0.6
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.28□□□□□ -0.6
NOMO3-201ENST00000263012 MDFIQ99750 246 aa11.28□□□□□ -0.6
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa11.26□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 F8WDY8 70 aa11.26□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 IGKV2-30P06310 120 aa11.26□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 COA5Q86WW8 74 aa11.25□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 PRR15Q8IV56 129 aa11.25□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 TENM2Q9NT68 2774 aa11.24□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa11.24□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 LIMD2Q9BT23 127 aa11.23□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 A8MWP4 228 aa11.22□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa11.21□□□□□ -0.61
NOMO3-201ENST00000263012 K7EIL1 84 aa11.19□□□□□ -0.62
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.18□□□□□ -0.62
NOMO3-201ENST00000263012 SPACA4Q8TDM5 124 aa11.16□□□□□ -0.62
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1B0GW54 56 aa11.15□□□□□ -0.63
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa11.13□□□□□ -0.63
NOMO3-201ENST00000263012 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.12□□□□□ -0.63
NOMO3-201ENST00000263012 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa11.11□□□□□ -0.63
NOMO3-201ENST00000263012 WIPF1O43516 503 aa11.1□□□□□ -0.63
NOMO3-201ENST00000263012 TLX1NBP0CAT3 122 aa11.1□□□□□ -0.63
NOMO3-201ENST00000263012 SPRR4Q96PI1 79 aa11.08□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 C8orf17Q9NRJ1 99 aa11.07□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa11.06□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 RTL8CO15255 209 aa11.05□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1B0GU69 56 aa11.04□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 NUPR2A6NF83 97 aa11.04□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 CNBPP62633 177 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa11.03□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 A8MU10 97 aa11.03□□□□□ -0.64
NOMO3-201ENST00000263012 C9orf163Q8N9P6 203 aa11.02□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa11.01□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 C1orf134Q5TEV5 83 aa11.01□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa11□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.99□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa10.99□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.98□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 H3BPC8 53 aa10.98□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 SPRR1AP35321 89 aa10.97□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.97□□□□□ -0.65
NOMO3-201ENST00000263012 A0A1B0GVX0 72 aa10.96□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 ACYP2P14621 99 aa10.96□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 AKAP9Q99996 3911 aa10.96□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 Q1T7F1 81 aa10.94□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00313P59037 77 aa10.94□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.94□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 TGP01266 2768 aa10.93□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.91□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 PANO1I0J062 215 aa10.91□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa10.91□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 TNP2Q05952 138 aa10.9□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.9□□□□□ -0.66
NOMO3-201ENST00000263012 Q5VV11 94 aa10.9□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 CSMD3Q7Z407 3707 aa10.89□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.89□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 CD164Q04900 197 aa10.87□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.87□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.86□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 A0A087WTM6 91 aa10.86□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 ZNF861PO60384 105 aa10.85□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 Q96NJ1 140 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 APLNQ9ULZ1 77 aa10.84□□□□□ -0.67
NOMO3-201ENST00000263012 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 PRAC1Q96KF2 57 aa10.83□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 SPINK7P58062 85 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.81□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 COL7A1Q02388 2944 aa10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 Q8N1X5 172 aa10.8□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 A0A087X002 238 aa10.78□□□□□ -0.68
NOMO3-201ENST00000263012 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms