RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.29□□□□□ -1.4
PDCL-201ENST00000259467 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.28□□□□□ -1.4
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PDCL-201ENST00000259467 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 C1orf195Q5TG92 126 aa6.27□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 RYR3Q15413 4870 aa6.26□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 LCE6AA0A183 80 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.25□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.25□□□□□ -1.41
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PDCL-201ENST00000259467 V9GYY9 64 aa6.24□□□□□ -1.41
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PDCL-201ENST00000259467 C16orf90A8MZG2 172 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.23□□□□□ -1.41
PDCL-201ENST00000259467 hDV103S1A0JD37 113 aa6.23□□□□□ -1.41
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PDCL-201ENST00000259467 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PDCL-201ENST00000259467 PKHD1P08F94 4074 aa6.15□□□□□ -1.42
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PDCL-201ENST00000259467 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.14□□□□□ -1.43
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PDCL-201ENST00000259467 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
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PDCL-201ENST00000259467 Q6ZR54 194 aa6.13□□□□□ -1.43
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PDCL-201ENST00000259467 IGFL1Q6UW32 110 aa6.12□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.11□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 PKD1P98161 4303 aa6.11□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.11□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 MP68P56378 58 aa6.11□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 PRLHP81277 87 aa6.1□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.1□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 CHTF8P0CG12 524 aa6.09□□□□□ -1.43
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PDCL-201ENST00000259467 PSPHP1O15172 72 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 RTL8CO15255 209 aa6.09□□□□□ -1.43
PDCL-201ENST00000259467 C1orf134Q5TEV5 83 aa6.08□□□□□ -1.44
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PDCL-201ENST00000259467 H3BPC8 53 aa6.07□□□□□ -1.44
PDCL-201ENST00000259467 PANO1I0J062 215 aa6.06□□□□□ -1.44
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PDCL-201ENST00000259467 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
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PDCL-201ENST00000259467 A8MUN3 132 aa6.03□□□□□ -1.44
PDCL-201ENST00000259467 UBE2AP49459 152 aa6.03□□□□□ -1.44
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PDCL-201ENST00000259467 KRTAP10-2P60368 255 aa6.03□□□□□ -1.44
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PDCL-201ENST00000259467 Q5VV11 94 aa6.01□□□□□ -1.45
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PDCL-201ENST00000259467 A0A087WSZ3 146 aa6.01□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.01□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
PDCL-201ENST00000259467 LINC00483Q53H64 154 aa6□□□□□ -1.45
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