RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 K7EIL1 84 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 BCE1O60756 84 aa8.51□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 WIPF1O43516 503 aa8.5□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 HCG22E2RYF7 251 aa8.48□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.05
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.46□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 TGP01266 2768 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFS5O43920 106 aa8.45□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 MP68P56378 58 aa8.44□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.43□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR1AP35321 89 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 LYSTQ99698 3801 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 F8WDY8 70 aa8.42□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 TNP2Q05952 138 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 C16orf90A8MZG2 172 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 CASC2Q6XLA1 102 aa8.41□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 PCOTHQ58A44 107 aa8.4□□□□□ -1.06
TMOD1-201ENST00000259365 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.39□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR4Q96PI1 79 aa8.38□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 PANO1I0J062 215 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 PRO0628Q9UI54 55 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 B9D2Q9BPU9 175 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 H0Y9P7 68 aa8.37□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.35□□□□□ -1.07
TMOD1-201ENST00000259365 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.33□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 MDFIQ99750 246 aa8.32□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 NDUFB1O75438 58 aa8.31□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 hDV103S1A0JD37 113 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 A8MUN3 132 aa8.3□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 CDK2AP2O75956 126 aa8.29□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 PRR15Q8IV56 129 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 C14orf177Q52M58 125 aa8.28□□□□□ -1.08
TMOD1-201ENST00000259365 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 MOBPQ13875 183 aa8.27□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GW54 56 aa8.26□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.26□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.26□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 APLNQ9ULZ1 77 aa8.26□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.25□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf195Q5TG92 126 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.24□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 A8MWP4 228 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 FBN3Q75N90 2809 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 A8MU10 97 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 PRR15LQ9BU68 103 aa8.23□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.21□□□□□ -1.09
TMOD1-201ENST00000259365 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
TMOD1-201ENST00000259365 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-201ENST00000259365 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.18□□□□□ -1.1
TMOD1-201ENST00000259365 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.16□□□□□ -1.1
TMOD1-201ENST00000259365 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.15□□□□□ -1.1
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087X002 238 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 A6NED7 52 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 LY6G6CO95867 125 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.14□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 RTL8CO15255 209 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 LCE6AA0A183 80 aa8.13□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.12□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 PMAIP1Q13794 54 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 COA5Q86WW8 74 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.11□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 A0A087WTM6 91 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.1□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 NUPR2A6NF83 97 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 Q1T7F1 81 aa8.09□□□□□ -1.11
TMOD1-201ENST00000259365 V9GYY9 64 aa8.08□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 CD164Q04900 197 aa8.07□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.06□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 SPRR1BP22528 89 aa8.05□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1B0GVX0 72 aa8.04□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 Q5VV11 94 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.03□□□□□ -1.12
TMOD1-201ENST00000259365 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF861PO60384 105 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.01□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.01□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 Q96NJ1 140 aa8□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 C1orf134Q5TEV5 83 aa8□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 LIMD2Q9BT23 127 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 H3BPC8 53 aa7.98□□□□□ -1.13
TMOD1-201ENST00000259365 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms