RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 NKAPP1Q8N9T2 125 aa16.88■□□□□ 0.29
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CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM254Q8TBM7 123 aa16.88■□□□□ 0.29
CAPNS1-201ENST00000246533 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa16.88■□□□□ 0.29
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CAPNS1-201ENST00000246533 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa16.87■□□□□ 0.29
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRCOL1A6NCL2 159 aa16.86■□□□□ 0.29
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CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa16.78■□□□□ 0.28
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CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf177Q52M58 125 aa16.49■□□□□ 0.23
CAPNS1-201ENST00000246533 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa16.48■□□□□ 0.23
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CAPNS1-201ENST00000246533 hDV103S1A0JD37 113 aa16.35■□□□□ 0.21
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CAPNS1-201ENST00000246533 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa16.24■□□□□ 0.19
CAPNS1-201ENST00000246533 ABCA13Q86UQ4 5058 aa16.24■□□□□ 0.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 MP68P56378 58 aa16.22■□□□□ 0.19
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CAPNS1-201ENST00000246533 A0A087WSZ3 146 aa16.15■□□□□ 0.18
CAPNS1-201ENST00000246533 PCLOQ9Y6V0 5065 aa16.15■□□□□ 0.18
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CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2AP49459 152 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N1X5 172 aa16.13■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PRLHP81277 87 aa16.11■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV22A0A0B4J277 110 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 PKIGQ9Y2B9 76 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 V9GYY9 64 aa16.1■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa16.09■□□□□ 0.17
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A1W2PNN7 141 aa16.08■□□□□ 0.16
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