RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229304.4

APOBEC1-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC1, Length 879 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 DPH3Q96FX2 82 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 DSCR8Q96T75 97 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 DNAH11Q96DT5 4516 aa5.94□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 BCE1O60756 84 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 ERC2-IT1O76042 136 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.93□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 RYR3Q15413 4870 aa5.92□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 MT-ATP8P03928 68 aa5.92□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 SCGB1A1P11684 91 aa5.92□□□□□ -1.46
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APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.91□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.9□□□□□ -1.46
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APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GV72 72 aa5.9□□□□□ -1.46
APOBEC1-201ENST00000229304 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.9□□□□□ -1.46
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APOBEC1-201ENST00000229304 Q6Q795 121 aa5.89□□□□□ -1.47
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APOBEC1-201ENST00000229304 IMUPQ9GZP8 106 aa5.88□□□□□ -1.47
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.86□□□□□ -1.47
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APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.86□□□□□ -1.47
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APOBEC1-201ENST00000229304 Q8N1X5 172 aa5.85□□□□□ -1.47
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APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP10-1P60331 282 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 C1orf137Q5JT78 98 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM30AQ9NZY2 134 aa5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00483Q53H64 154 aa5.82□□□□□ -1.48
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.78□□□□□ -1.48
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APOBEC1-201ENST00000229304 CXCL6P80162 114 aa5.78□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 IGFL1Q6UW32 110 aa5.78□□□□□ -1.48
APOBEC1-201ENST00000229304 A0A1B0GVY2 172 aa5.77□□□□□ -1.49
APOBEC1-201ENST00000229304 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.77□□□□□ -1.49
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APOBEC1-201ENST00000229304 NREPQ16612 68 aa5.76□□□□□ -1.49
APOBEC1-201ENST00000229304 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
APOBEC1-201ENST00000229304 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
APOBEC1-201ENST00000229304 HAMPP81172 84 aa5.74□□□□□ -1.49
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APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WSZ3 146 aa5.69□□□□□ -1.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 C9orf153Q5TBE3 101 aa5.69□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.69□□□□□ -1.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 A0A087WVE0 104 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ATOX1O00244 68 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 MOBPQ13875 183 aa5.66□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.66□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
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APOBEC1-201ENST00000229304 IGKV4-1P06312 121 aa5.65□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 DSCR10P59022 87 aa5.65□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 CD164Q04900 197 aa5.65□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.65□□□□□ -1.5
APOBEC1-201ENST00000229304 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
APOBEC1-201ENST00000229304 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.64□□□□□ -1.51
APOBEC1-201ENST00000229304 J3KT08 172 aa5.63□□□□□ -1.51
APOBEC1-201ENST00000229304 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.63□□□□□ -1.51
APOBEC1-201ENST00000229304 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.63□□□□□ -1.51
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