RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 DPH3Q96FX2 82 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM218AQ96MZ4 157 aa15.69■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 DIRC1Q969H9 104 aa15.68■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A087WYN8 130 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 PRYO14603 147 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 DNAH5Q8TE73 4624 aa15.66■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP15.65■□□□□ 0.1
CAPNS1-215ENST00000628018 TRACP01848 142 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR1AP35321 89 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 PLAC8Q9NZF1 115 aa15.62■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 COX7BP24311 80 aa15.6■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 KRTAP10-1P60331 282 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 PRO0461Q9UI25 63 aa15.59■□□□□ 0.09
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A1B0GVY2 172 aa15.58■□□□□ 0.09
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CAPNS1-215ENST00000628018 C9JAW5 83 aa15.57■□□□□ 0.08
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CAPNS1-215ENST00000628018 B5MCH6 92 aa15.53■□□□□ 0.08
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CAPNS1-215ENST00000628018 SLC25A20O43772 301 aa15.52■□□□□ 0.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 Q6ZRX8 168 aa15.5■□□□□ 0.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 H3BT86 120 aa15.46■□□□□ 0.07
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CAPNS1-215ENST00000628018 SCXQ7RTU7 201 aa15.45■□□□□ 0.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-215ENST00000628018 BAALC-AS2P0C853 105 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-215ENST00000628018 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa15.43■□□□□ 0.06
CAPNS1-215ENST00000628018 ORMDL1Q9P0S3 153 aa15.42■□□□□ 0.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP15.4■□□□□ 0.06
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CAPNS1-215ENST00000628018 H0Y9J4 135 aa15.38■□□□□ 0.05
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CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-215ENST00000628018 ERC2-IT1O76042 136 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-215ENST00000628018 UBE2AP49459 152 aa15.33■□□□□ 0.04
CAPNS1-215ENST00000628018 H3BQ85 93 aa15.3■□□□□ 0.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP15.3■□□□□ 0.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 GHRHP01286 108 aa15.28■□□□□ 0.04
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CAPNS1-215ENST00000628018 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa15.26■□□□□ 0.03
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa15.24■□□□□ 0.03
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CAPNS1-215ENST00000628018 XGP55808 180 aa15.23■□□□□ 0.03
CAPNS1-215ENST00000628018 Q8N377 158 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-215ENST00000628018 DEFB105AQ8NG35 78 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-215ENST00000628018 PPDPFLQ8WWR9 84 aa15.22■□□□□ 0.03
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF861PO60384 105 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV7-43P04211 117 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-215ENST00000628018 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa15.2■□□□□ 0.02
CAPNS1-215ENST00000628018 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa15.16■□□□□ 0.02
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CAPNS1-215ENST00000628018 C3orf22Q8N5N4 141 aa15.09■□□□□ 0.01
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CAPNS1-215ENST00000628018 C14orf132Q9NPU4 83 aa15.08■□□□□ 0.01
CAPNS1-215ENST00000628018 GAGE2AQ6NT46 116 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-215ENST00000628018 SPRR4Q96PI1 79 aa15.07■□□□□ 0
CAPNS1-215ENST00000628018 K7ERU9 68 aa15.06■□□□□ 0
CAPNS1-215ENST00000628018 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP15.05■□□□□ 0
CAPNS1-215ENST00000628018 J3QR89 54 aa15.05■□□□□ -0
CAPNS1-215ENST00000628018 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
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