RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623052.1

C9orf170-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 170, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf170, Length 3,239 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 C7orf33Q8WU49 177 aa8.68□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 SCXQ7RTU7 201 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 CXCL6P80162 114 aa8.67□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 NOTCH1P46531 2555 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 FAM168BA1KXE4 195 aa8.66□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 OXTP01178 125 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM258P61165 79 aa8.65□□□□□ -1.02
C9orf170-201ENST00000623052 F8WDY8 70 aa8.65□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.64□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N377 158 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 DPH3Q96FX2 82 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.63□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 J3KT08 172 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 Q9BRP9 147 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 C20orf197Q8N268 126 aa8.62□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.61□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.6□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 Q8N9L7 120 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 BCE1O60756 84 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 Q6ZRX8 168 aa8.59□□□□□ -1.03
C9orf170-201ENST00000623052 SPRR1AP35321 89 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 MRAPQ8TCY5 172 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.58□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 C3orf84H3BNL1 204 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV4-1P06312 121 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.57□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 H7BZZ5 65 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 TNP2Q05952 138 aa8.56□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 COL7A1Q02388 2944 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 BPY2O14599 106 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 ERC2-IT1O76042 136 aa8.55□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 PRYO14603 147 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 KLKP1Q107X0 134 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 SNURFQ9Y675 71 aa8.54□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PNM2 257 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 RMI2Q96E14 147 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 COL6A5A8TX70 2615 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 K7EIL1 84 aa8.53□□□□□ -1.04
C9orf170-201ENST00000623052 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.52□□□□□ -1.04
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C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.52□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 NREPQ16612 68 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.5□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 FAM236CP0DP71 79 aa8.48□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 EPM2AB3EWF7 344 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 C1orf137Q5JT78 98 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 Q5XG85 94 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 SMIM29Q86T20 159 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 OCR1Q9BZK8 76 aa8.47□□□□□ -1.05
C9orf170-201ENST00000623052 F8WEM9 126 aa8.46□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 Q8NBF4 154 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 A0A096LNI7 61 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0G2JQZ4 141 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1W2PNN7 141 aa8.45□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 SPRR4Q96PI1 79 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 REG3GQ6UW15 175 aa8.44□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 UBE2BP63146 152 aa8.43□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP8.43□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.42□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 DSCR10P59022 87 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 C4orf26Q17RF5 130 aa8.41□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 PRLHP81277 87 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.4□□□□□ -1.06
C9orf170-201ENST00000623052 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.4□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 A0A1B0GW54 56 aa8.4□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 A0A0U1RQV1 116 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 C16orf90A8MZG2 172 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.39□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 K7EQZ3 153 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 IGFL1Q6UW32 110 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 TENM2Q9NT68 2774 aa8.37□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 CHTF8P0CG12 524 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.36□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.35□□□□□ -1.07
C9orf170-201ENST00000623052 NDUFC1O43677 76 aa8.35□□□□□ -1.07
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