RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	MIF	P14174	115 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	DAD1	P61803	113 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	C15orf56	Q8N910	161 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	BCE1	O60756	84 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	KLK12	Q9UKR0	248 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RDM1-223	ENST00000619193	APOC4	P55056	127 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM258	P61165	79 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	CASC10	Q5T4H9	136 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZVQ6	151 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	DPH3	Q96FX2	82 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		H3BNG1	76 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		J3KT08	172 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZQY7	126 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	COX7B	P24311	80 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		Q5XG85	94 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZRU5	148 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	DIRC1	Q969H9	104 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	C3orf84	H3BNL1	204 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		H3BQ85	93 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		H7BZZ5	65 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		K7EIL1	84 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		M0R378	163 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP10-11	P60412	298 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	CXCL6	P80162	114 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	RETN	Q9HD89	108 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	HTN3	P15516	51 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	PDE6G	P18545	87 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	ESRG	Q1W209	222 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	DSCR8	Q96T75	97 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	UBL5	Q9BZL1	73 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		F8WDY8	70 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KLKP1	Q107X0	134 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZRP5	223 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	IGKV4-1	P06312	121 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	SPRR1A	P35321	89 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193		Q6ZTC4	211 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	C7orf33	Q8WU49	177 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		3.84	□□□□□ -1.79
RDM1-223	ENST00000619193	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	C20orf197	Q8N268	126 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193		Q8N377	158 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		3.83	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	SCX	Q7RTU7	201 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	RMI2	Q96E14	147 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	OCR1	Q9BZK8	76 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193		A0A1W2PNM2	257 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	FAM236C	P0DP71	79 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	HAMP	P81172	84 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193		Q9BRP9	147 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	LYST	Q99698	3801 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193		A0A0U1RQV1	116 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	ERC2-IT1	O76042	136 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	B9D2	Q9BPU9	175 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		3.8	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	BPY2	O14599	106 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	PRY	O14603	147 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	NREP	Q16612	68 aa		3.79	□□□□□ -1.8
RDM1-223	ENST00000619193	C4orf26	Q17RF5	130 aa		3.79	□□□□□ -1.8

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