RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608369.1

LINC00963-211, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00963, Length 961 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-211ENST00000608369 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 IGKV2D-28P01615 120 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 Q6ZRU5 148 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 SNCGO76070 127 aa7.24□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 A0A1B0GX51 115 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 H3BMG7 143 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 LST1O00453 97 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 LINC01620Q4KN68 170 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 LINC01600Q96MT4 127 aa7.23□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 TCL1BO95988 128 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 TRACP01848 142 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.22□□□□□ -1.25
LINC00963-211ENST00000608369 H3BT86 120 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 LINC00526Q96FQ7 95 aa7.21□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 M0R378 163 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 IGLV6-57P01721 117 aa7.2□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 J3QR89 54 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 PRO0461Q9UI25 63 aa7.19□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 H3BQ85 93 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 K7ERU9 68 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 VPREB1P12018 145 aa7.18□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 SLC25A20O43772 301 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 DNAL4O96015 105 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 Q6ZRP5 223 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.17□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 C9JAW5 83 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 MT1HL1P0DM35 61 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 TEN1Q86WV5 123 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 NCR3O14931 201 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 GAGE2EQ4V326 116 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 DIRC1Q969H9 104 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-211ENST00000608369 RNF213Q63HN8 5207 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 CLEC2BQ92478 149 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 SLPIP03973 132 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 C7orf33Q8WU49 177 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 LRP2P98164 4655 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 PRYO14603 147 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 C6orf99Q4VX62 202 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 Q8NDZ9 215 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.11□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 ETDBQ3ZM63 59 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 DPH3Q96FX2 82 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 LINC00167Q96N53 147 aa7.1□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 GAGE2BQ13066 116 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 ORMDL1Q9P0S3 153 aa7.09□□□□□ -1.27
LINC00963-211ENST00000608369 COX7BP24311 80 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 LINC00575Q6W349 94 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.08□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 A0A087WYN8 130 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 hADV29S1A0JD25 119 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.07□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 TNXBP22105 4242 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 A0A096LNI7 61 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 PANO1I0J062 215 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 REG3GQ6UW15 175 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 MTURNQ8N3F0 131 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 C22orf24Q9Y442 160 aa7.05□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 SPRR1AP35321 89 aa7.04□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
LINC00963-211ENST00000608369 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-211ENST00000608369 ACYP1P07311 99 aa7.02□□□□□ -1.29
LINC00963-211ENST00000608369 Q6ZRX8 168 aa7.01□□□□□ -1.29
LINC00963-211ENST00000608369 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7□□□□□ -1.29
LINC00963-211ENST00000608369 PDE6GP18545 87 aa7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 185.3 ms