RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604516.1

HMGN3-AS1-201, HMGN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HMGN3-AS1, Length 2,946 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C7orf33Q8WU49 177 aa7.67□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.67□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UQCRQO14949 82 aa7.66□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATOX1O00244 68 aa7.65□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HAMPP81172 84 aa7.65□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.65□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.65□□□□□ -1.18
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 COX7CP15954 63 aa7.65□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZVQ6 151 aa7.64□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.64□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.63□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.63□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.63□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.63□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.63□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UPK3BQ9BT76 320 aa7.63□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.62□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.62□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 F8WDY8 70 aa7.62□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SCXQ7RTU7 201 aa7.62□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.61□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.61□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 H3BQ85 93 aa7.6□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.6□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PDE6GP18545 87 aa7.6□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SERP2Q8N6R1 65 aa7.59□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 GHRHP01286 108 aa7.59□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N377 158 aa7.59□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q9BRP9 147 aa7.59□□□□□ -1.19
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.58□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.58□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 RMI2Q96E14 147 aa7.57□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q6ZRX8 168 aa7.57□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CRYGAP11844 174 aa7.56□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C3orf84H3BNL1 204 aa7.56□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.55□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.55□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 ERC2-IT1O76042 136 aa7.55□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.55□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8N9L7 120 aa7.54□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MDFIQ99750 246 aa7.54□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.53□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR1AP35321 89 aa7.53□□□□□ -1.2
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRYO14603 147 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PSCAO43653 123 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A096LNI7 61 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2BP63146 152 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CXCL6P80162 114 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.52□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PNN7 141 aa7.51□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.5□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NREPQ16612 68 aa7.49□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C20orf197Q8N268 126 aa7.49□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 APLNQ9ULZ1 77 aa7.49□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A0G2JQZ4 141 aa7.49□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CHTF8P0CG12 524 aa7.48□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 REG3GQ6UW15 175 aa7.48□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 A0A1W2PNM2 257 aa7.48□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRLHP81277 87 aa7.48□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BPY2O14599 106 aa7.47□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C1orf137Q5JT78 98 aa7.47□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.21
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C16orf90A8MZG2 172 aa7.46□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TNP2Q05952 138 aa7.46□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.45□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C4orf26Q17RF5 130 aa7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SNURFQ9Y675 71 aa7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.44□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 IGKV4-1P06312 121 aa7.43□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TGP01266 2768 aa7.43□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SMIM29Q86T20 159 aa7.43□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 C5orf47Q569G3 176 aa7.42□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 B9D2Q9BPU9 175 aa7.42□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.41□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 Q8NBF4 154 aa7.41□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.41□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 TMEM258P61165 79 aa7.41□□□□□ -1.22
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.4□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 OXTP01178 125 aa7.39□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DPH3Q96FX2 82 aa7.39□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 KMT2AQ03164 3969 aa7.39□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 PANO1I0J062 215 aa7.39□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 LRCOL1A6NCL2 159 aa7.38□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.38□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 J3KT08 172 aa7.38□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 BCE1O60756 84 aa7.38□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.37□□□□□ -1.23
HMGN3-AS1-201ENST00000604516 SPRR4Q96PI1 79 aa7.37□□□□□ -1.23
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