RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 H0Y8G0 127 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 CFC1BP0CG36 223 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 PCOTHQ58A44 107 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.61□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 C5orf52A6NGY3 159 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 J3QQQ9 107 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 HSBP1O75506 76 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 LIMD2Q9BT23 127 aa5.6□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 APOC3P02656 99 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 PLNP26678 52 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 NMUP48645 174 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 YPEL4Q96NS1 127 aa5.59□□□□□ -1.51
EFTUD2-226ENST00000593200 C9orf92A6NGG3 77 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SNAPINO95295 136 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SPRR1BP22528 89 aa5.58□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 LEPROTL1O95214 131 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 HERVK_113P61574 105 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 NPC2P61916 151 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SVBPQ8N300 66 aa5.57□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 DPM2O94777 84 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 NDUFA5Q16718 116 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.56□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0J9YXY3 114 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 IGKCP01834 107 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.55□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00310P59036 64 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 SERF1AO75920 110 aa5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 CD164Q04900 197 aa5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.53□□□□□ -1.52
EFTUD2-226ENST00000593200 FABP4P15090 132 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SPANXCQ9NY87 97 aa5.52□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 E9PLD3 99 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TRGC2P03986 189 aa5.51□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 M0R2T5 61 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 Q1RN00 199 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 Q5XG85 94 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 LITAFQ99732 161 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 PRO1933Q9H354 126 aa5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 H7C2G1 150 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TAL2Q16559 108 aa5.49□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 TIMM17BO60830 172 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 COX7BP24311 80 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 C6orf99Q4VX62 202 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 C1orf195Q5TG92 126 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.48□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 AKR1D1P51857 326 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 SMIM29Q86T20 159 aa5.47□□□□□ -1.53
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.45□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A0G2JQZ4 141 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.44□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 A0A1B0GWB2 263 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 ZNF815PA8K554 130 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa5.43□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TTTY13Q9BZ97 58 aa5.42□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 TCL1BO95988 128 aa5.4□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC01545Q5VT33 79 aa5.4□□□□□ -1.54
EFTUD2-226ENST00000593200 A4D1N5 150 aa5.38□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 COLCA2A8K830 154 aa5.38□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.38□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 PET117Q6UWS5 81 aa5.38□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 A6NDN8 102 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 COPS9Q8WXC6 57 aa5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 IFITM1P13164 125 aa5.36□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 H3BS24 57 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 Q6Q795 121 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 Q75L30 129 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 USH2AO75445 5202 aa5.35□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 F8WEM9 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BKO60814 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BJP06899 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 C3orf79P0CE67 100 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BOP23527 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BBP33778 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BDP58876 126 aa5.34□□□□□ -1.55
EFTUD2-226ENST00000593200 HIST1H2BCP62807 126 aa5.34□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms