RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 ATOX1O00244 68 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 C15orf56Q8N910 161 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8NDZ9 215 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.12□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A0A0MQY5 61 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 VPREB1P12018 145 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 SYCNQ0VAF6 134 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZRU5 148 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 UBL5Q9BZL1 73 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00846Q9NV44 126 aa6.11□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 DSCR8Q96T75 97 aa6.1□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZQY7 126 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.09□□□□□ -1.43
EFTUD2-222ENST00000592408 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC179H3BU77 68 aa6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 UQCRQO14949 82 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZQT0 140 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 MRAPQ8TCY5 172 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.07□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 VWFP04275 2813 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.06□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 UPK3BQ9BT76 320 aa6.05□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 STAB1Q9NY15 2570 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 COX7CP15954 63 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZRP5 223 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.04□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.03□□□□□ -1.44
EFTUD2-222ENST00000592408 SERP2Q8N6R1 65 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.02□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCL6P80162 114 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 C7orf33Q8WU49 177 aa6.01□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 K7EIL1 84 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 BCE1O60756 84 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 SMIM20Q8N5G0 67 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 PKIGQ9Y2B9 76 aa6□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 CRYGAP11844 174 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZVQ6 151 aa5.99□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A087WVE0 104 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 A0A1B0GW54 56 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 C14orf177Q52M58 125 aa5.98□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 HAMPP81172 84 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 Q6ZRX8 168 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.97□□□□□ -1.45
EFTUD2-222ENST00000592408 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 DNHD1Q96M86 4753 aa5.96□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 SPRR1AP35321 89 aa5.95□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 PSCAO43653 123 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM258P61165 79 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa5.94□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP5.93□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.93□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 RPL37AP8A6NKH3 93 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 CASC10Q5T4H9 136 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 REG3GQ6UW15 175 aa5.92□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM168BA1KXE4 195 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 C16orf90A8MZG2 172 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 F8WEM9 126 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 M0R2N4 97 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 UBE2BP63146 152 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 NREPQ16612 68 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.91□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 Q8N377 158 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 B9D2Q9BPU9 175 aa5.9□□□□□ -1.46
EFTUD2-222ENST00000592408 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa5.9□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 NUPR2A6NF83 97 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 J3KT08 172 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 Q9BRP9 147 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.89□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 BPY2O14599 106 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 APLNQ9ULZ1 77 aa5.88□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 ANK2Q01484 3957 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.87□□□□□ -1.47
EFTUD2-222ENST00000592408 C1orf137Q5JT78 98 aa5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 123.7 ms