RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589853.3

GTF3C2-AS1-207, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 HSBP1O75506 76 aa3.08□□□□□ -1.92
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GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 PLEKHB2Q96CS7 222 aa2.99□□□□□ -1.93
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GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa2.98□□□□□ -1.93
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GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 IGKCP01834 107 aa2.98□□□□□ -1.93
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GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 LINC00483Q53H64 154 aa2.98□□□□□ -1.93
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GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.98□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.98□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 COPS9Q8WXC6 57 aa2.98□□□□□ -1.93
GTF3C2-AS1-207ENST00000589853 C12orf57Q99622 126 aa2.98□□□□□ -1.93
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