RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588707.5

GTF3C2-AS1-205, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene GTF3C2-AS1, Length 607 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LST1O00453 97 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TRACP01848 142 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q8NDZ9 215 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DIRC1Q969H9 104 aa4.67□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 EPM2AB3EWF7 344 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAL4O96015 105 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 GHRHP01286 108 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HAMPP81172 84 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C6orf99Q4VX62 202 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DPH3Q96FX2 82 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C22orf24Q9Y442 160 aa4.66□□□□□ -1.66
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRYO14603 147 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SLC25A20O43772 301 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC01620Q4KN68 170 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q5VSD8 79 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C7orf33Q8WU49 177 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CLEC2BQ92478 149 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.65□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM168BA1KXE4 195 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C9JAW5 83 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H3BQ85 93 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H3BT86 120 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 M0QXV9 152 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 COX7BP24311 80 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00167Q96N53 147 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAT1Q14517 4588 aa4.64□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.63□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A1W2PNN7 141 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 hADV29S1A0JD25 119 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CHTF8P0CG12 524 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBE2BP63146 152 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 REG3GQ6UW15 175 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00575Q6W349 94 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC01600Q96MT4 127 aa4.62□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 RPL37AP8A6NKH3 93 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM229AH3BQW9 127 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SPRR1AP35321 89 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRO0461Q9UI25 63 aa4.61□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 A0A087WYN8 130 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q6ZSA8 131 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LINC00528Q8N1L1 170 aa4.6□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 J3QR89 54 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q6ZRX8 168 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TEN1Q86WV5 123 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MTURNQ8N3F0 131 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 B5MCH6 92 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 ETDBQ3ZM63 59 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SCXQ7RTU7 201 aa4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 H0Y9J4 135 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 K7ERU9 68 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.57□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PANO1I0J062 215 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q6ZQY7 126 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.56□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 BCE1O60756 84 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 UBE2AP49459 152 aa4.55□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HERC1Q15751 4861 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 MYCBP2O75592 4640 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.54□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 Q9BRP9 147 aa4.53□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.53□□□□□ -1.68
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.52□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.52□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PRLHP81277 87 aa4.52□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.52□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.51□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 J3QL48 77 aa4.51□□□□□ -1.69
GTF3C2-AS1-205ENST00000588707 PDE6GP18545 87 aa4.51□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms