RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 Q8N377 158 aa10.26□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa10.25□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP10.25□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 A0A0J9YXY3 114 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa10.24□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 E9PLD3 99 aa10.23□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 C5orf52A6NGY3 159 aa10.21□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 SLC25A20O43772 301 aa10.21□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 NPC2P61916 151 aa10.21□□□□□ -0.77
CTIF-206ENST00000588345 CBY1Q9Y3M2 126 aa10.19□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 LITAFQ99732 161 aa10.18□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 SPANXCQ9NY87 97 aa10.17□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa10.16□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 LINC00308Q8TCZ7 52 aa10.16□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa10.16□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 TIMM17BO60830 172 aa10.15□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
CTIF-206ENST00000588345 SPRR1BP22528 89 aa10.14□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 XP32Q5T750 250 aa10.14□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 LINC01545Q5VT33 79 aa10.13□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BKO60814 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BJP06899 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BOP23527 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BBP33778 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BDP58876 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BCP62807 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST2H2BEQ16778 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BHQ93079 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BNQ99877 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BMQ99879 126 aa10.12□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 SPANXDQ9BXN6 97 aa10.11□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 PET117Q6UWS5 81 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 OR13C6PQ8NH95 151 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.1□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 SLC25A34Q6PIV7 304 aa10.09□□□□□ -0.79
CTIF-206ENST00000588345 ZNF815PA8K554 130 aa10.08□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 LINC00518Q8N0U6 118 aa10.07□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 TTTY13Q9BZ97 58 aa10.06□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 COX7BP24311 80 aa10.05□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 LIMD2Q9BT23 127 aa10.05□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.05□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 C6orf99Q4VX62 202 aa10.04□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 C3orf79P0CE67 100 aa10.03□□□□□ -0.8
CTIF-206ENST00000588345 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa10.02□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 HRCT1Q6UXD1 115 aa10.01□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 CD164Q04900 197 aa10□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 TAL2Q16559 108 aa9.98□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 PRO1933Q9H354 126 aa9.97□□□□□ -0.81
CTIF-206ENST00000588345 IFITM1P13164 125 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 Q1RN00 199 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 LCE2CQ5TA81 110 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 COPS9Q8WXC6 57 aa9.96□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 A0A1B0GWB2 263 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 KRTDAPP60985 99 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 Q5XG85 94 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 SMIM29Q86T20 159 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 DEFB105AQ8NG35 78 aa9.95□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 Q6ZVH6 145 aa9.94□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.93□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 C20orf202A1L168 122 aa9.92□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 C9orf92A6NGG3 77 aa9.92□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 H7C2G1 150 aa9.92□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 PCOTHQ58A44 107 aa9.92□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 AKR1D1P51857 326 aa9.91□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 A6NDN8 102 aa9.9□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 MUSTN1Q8IVN3 82 aa9.9□□□□□ -0.82
CTIF-206ENST00000588345 A4D1N5 150 aa9.89□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.88□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 PCP2Q8IVA1 136 aa9.88□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 C1orf195Q5TG92 126 aa9.87□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 ATOH7Q8N100 152 aa9.87□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa9.86□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 HIST3H2BBQ8N257 126 aa9.85□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 A0A0G2JQZ4 141 aa9.84□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.84□□□□□ -0.83
CTIF-206ENST00000588345 MT1HP80294 61 aa9.83□□□□□ -0.84
CTIF-206ENST00000588345 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-206ENST00000588345 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.79□□□□□ -0.84
CTIF-206ENST00000588345 HIST1H2BLQ99880 126 aa9.79□□□□□ -0.84
CTIF-206ENST00000588345 S100A6P06703 90 aa9.77□□□□□ -0.85
CTIF-206ENST00000588345 TCL1BO95988 128 aa9.76□□□□□ -0.85
CTIF-206ENST00000588345 CFC1BP0CG36 223 aa9.76□□□□□ -0.85
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