RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB4AO15263 64 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF462Q96JM2 2506 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 COL12A1Q99715 3063 aa5.05□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 SCXQ7RTU7 201 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 JMJD1CQ15652 2540 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 FBN2P35556 2912 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 POLQO75417 2590 aa5.04□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 MP68P56378 58 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 Q1T7F1 81 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZTC4 211 aa5.03□□□□□ -1.6
CAPNS1-202ENST00000586851 hDV103S1A0JD37 113 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 HCG22E2RYF7 251 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 C3orf84H3BNL1 204 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PNM2 257 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 C11orf45Q8TAV5 145 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFHX3Q15911 3703 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 APCP25054 2843 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 H0Y9J4 135 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf195Q5TG92 126 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 REG3GQ6UW15 175 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 SMIM29Q86T20 159 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 C14orf177Q52M58 125 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 HIVEP2P31629 2446 aa4.99□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 SONP18583 2426 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 VPS13CQ709C8 3753 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 DSCR10P59022 87 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2BP63146 152 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8N9L7 120 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 Q9BRP9 147 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.98□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR15Q8IV56 129 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 BRK1Q8WUW1 75 aa4.97□□□□□ -1.61
CAPNS1-202ENST00000586851 SPRR1BP22528 89 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00476Q8WZB0 136 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 CENPEQ02224 2701 aa4.96□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 AKAP9Q99996 3911 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 PSCAO43653 123 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 LIMD2Q9BT23 127 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM30AQ9NZY2 134 aa4.95□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.95□□□□□ -1.62
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CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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CAPNS1-202ENST00000586851 INAFM1C9JVW0 142 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 K7EQZ3 153 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 CCDC168Q8NDH2 2452 aa4.94□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.93□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 A8MWP4 228 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 IGFL1Q6UW32 110 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.92□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 CASC2Q6XLA1 102 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 B9D2Q9BPU9 175 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 PDZD2O15018 2839 aa4.91□□□□□ -1.62
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 UBE2AP49459 152 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 SMR3AQ99954 134 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 NF1P21359 2839 aa4.9□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 MOBPQ13875 183 aa4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 MTORP42345 2549 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A087WSZ3 146 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 H0Y9P7 68 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP10-11P60412 298 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00208Q96KT6 92 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 RETNQ9HD89 108 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 NOTCH2Q04721 2471 aa4.88□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM168BA1KXE4 195 aa4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.86□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 TENM4Q6N022 2769 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 PMAIP1Q13794 54 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.84□□□□□ -1.63
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf163Q8N9P6 203 aa4.84□□□□□ -1.63
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