RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 M0R378 163 aa4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 VPREB1P12018 145 aa4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 PRR3P79522 188 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 Q8NDZ9 215 aa4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 TM2D3Q9BRN9 247 aa4.15□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 COX7BP24311 80 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 HIGD2BQ4VC39 106 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 Q6ZRU5 148 aa4.14□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 SYCNQ0VAF6 134 aa4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
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CLTC-211ENST00000579815 UPK3BQ9BT76 320 aa4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 ATRQ13535 2644 aa4.13□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 ATOX1O00244 68 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 MT3P25713 68 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 Q6ZQT0 140 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 MRAPQ8TCY5 172 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 UBL5Q9BZL1 73 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 LINC00846Q9NV44 126 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.12□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.11□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 Q6ZQY7 126 aa4.11□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 DSCR8Q96T75 97 aa4.11□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.11□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 F8P00451 2351 aa4.11□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 UQCRQO14949 82 aa4.1□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 Q6ZRP5 223 aa4.1□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.1□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.1□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 LINC00588Q9Y4M8 146 aa4.1□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.09□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.09□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.09□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 K7EIL1 84 aa4.09□□□□□ -1.75
CLTC-211ENST00000579815 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 USP17L23D6RBM5 183 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 CCDC179H3BU77 68 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 BCE1O60756 84 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 COX7CP15954 63 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.08□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa4.07□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.07□□□□□ -1.76
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CLTC-211ENST00000579815 CXCL6P80162 114 aa4.07□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.07□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 SPRR1AP35321 89 aa4.06□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 C14orf177Q52M58 125 aa4.06□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 C7orf33Q8WU49 177 aa4.06□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 ANK2Q01484 3957 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 CRYGAP11844 174 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 Q6ZRX8 168 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 SERP2Q8N6R1 65 aa4.05□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.04□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.04□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 Q6ZVQ6 151 aa4.04□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.04□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.03□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.03□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 B9D2Q9BPU9 175 aa4.03□□□□□ -1.76
CLTC-211ENST00000579815 A0A087WVE0 104 aa4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 C16orf90A8MZG2 172 aa4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 MAST4O15021 2626 aa4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.02□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 NUPR2A6NF83 97 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 CASC10Q5T4H9 136 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 SMIM29Q86T20 159 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 APLNQ9ULZ1 77 aa4.01□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 M0R2N4 97 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 PSCAO43653 123 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 TMEM258P61165 79 aa4□□□□□ -1.77
CLTC-211ENST00000579815 HAMPP81172 84 aa4□□□□□ -1.77
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