RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575237.2

CREBBP-211, Transcript of CREB binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene CREBBP, Length 403 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREBBP-211ENST00000575237 BAGE3Q86Y29 109 aa7.3□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 YPEL4Q96NS1 127 aa7.3□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 SPRR1BP22528 89 aa7.29□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 HERV-K104P63124 156 aa7.29□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 Q6Q795 121 aa7.29□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 LINC00587B1AMM8 73 aa7.28□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 CD164Q04900 197 aa7.28□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 C1orf195Q5TG92 126 aa7.28□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 Q5XG85 94 aa7.28□□□□□ -1.24
CREBBP-211ENST00000575237 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.27□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 HBDP02042 147 aa7.26□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.26□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.25□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 LCE2BO14633 110 aa7.25□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 S100A2P29034 98 aa7.25□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 AKR1D1P51857 326 aa7.24□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.24□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.24□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 TRGC2P03986 189 aa7.23□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.23□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.23□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.23□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.22□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 H7C2G1 150 aa7.22□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 SMIM6P0DI80 62 aa7.22□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 PMCHL1Q16048 86 aa7.22□□□□□ -1.25
CREBBP-211ENST00000575237 NDUFC2O95298 119 aa7.21□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 MT2AP02795 61 aa7.21□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 LINC00614P0C842 121 aa7.21□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BKO60814 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BJP06899 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BOP23527 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BBP33778 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BDP58876 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BCP62807 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 SMIM29Q86T20 159 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 PRO1933Q9H354 126 aa7.2□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.19□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.19□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.18□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.17□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.17□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.17□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 C20orf202A1L168 122 aa7.15□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 MT1FP04733 61 aa7.15□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.15□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 Q1RN00 199 aa7.15□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.15□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 C12orf57Q99622 126 aa7.15□□□□□ -1.26
CREBBP-211ENST00000575237 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.14□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.14□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 Q75L30 129 aa7.13□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.13□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.12□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 LINC00846Q9NV44 126 aa7.12□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 LEPROTO15243 131 aa7.11□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 FABP4P15090 132 aa7.11□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.11□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 A0A0G2JQZ4 141 aa7.1□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.1□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 TAL2Q16559 108 aa7.1□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.1□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.1□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 TCL1BO95988 128 aa7.09□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.09□□□□□ -1.27
CREBBP-211ENST00000575237 NMUP48645 174 aa7.08□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 KRTAP10-10P60014 251 aa7.08□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 J3QQQ9 107 aa7.07□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 NPC2P61916 151 aa7.07□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 TSTD3H0UI37 97 aa7.06□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 HSBP1O75506 76 aa7.06□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 COX7BP24311 80 aa7.06□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.06□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.06□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 SERF1AO75920 110 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 PYY3Q5JQD4 70 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 PCP2Q8IVA1 136 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.04□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.03□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.03□□□□□ -1.28
CREBBP-211ENST00000575237 SCGB1D1O95968 90 aa7.02□□□□□ -1.29
CREBBP-211ENST00000575237 SPANXCQ9NY87 97 aa7.02□□□□□ -1.29
CREBBP-211ENST00000575237 A0A0J9YXY3 114 aa7.01□□□□□ -1.29
CREBBP-211ENST00000575237 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88.6 ms