RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570989.1

ITGA3-216, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

Gene ITGA3, Length 2,495 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-216ENST00000570989 Q6ZRU5 148 aa9.67□□□□□ -0.86
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