RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568328.5

VWA3A-208, Transcript of von Willebrand factor A domain containing 3A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene VWA3A, Length 2,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA3A-208ENST00000568328 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.98□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 SLPIP03973 132 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 KMT2AQ03164 3969 aa6.97□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 DEFB130BP0DP73 79 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 DEFB130AP0DP74 79 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.96□□□□□ -1.29
VWA3A-208ENST00000568328 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.96□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 C16orf90A8MZG2 172 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 ERC2-IT1O76042 136 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 Q6ZQT0 140 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.95□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 Q8IZM0 81 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 COX17Q14061 63 aa6.94□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.93□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 F8WEM9 126 aa6.92□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 PRM2P04554 102 aa6.92□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.92□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 Q6ZVQ6 151 aa6.92□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.91□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 TNP2Q05952 138 aa6.91□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 LINC00575Q6W349 94 aa6.9□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.9□□□□□ -1.3
VWA3A-208ENST00000568328 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.9□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.89□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 Q6ZTI0 123 aa6.89□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.89□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 RMI2Q96E14 147 aa6.89□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 DNAH2Q9P225 4427 aa6.88□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.88□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 HAMPP81172 84 aa6.88□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 Q8N1X5 172 aa6.88□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.88□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.87□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 C1orf195Q5TG92 126 aa6.87□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 SNURFQ9Y675 71 aa6.87□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 V9GYY9 64 aa6.87□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 A0A1B0GUV1 79 aa6.86□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 ESRGQ1W209 222 aa6.86□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 C6orf99Q4VX62 202 aa6.86□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 Q8N3U1 123 aa6.86□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 NREPQ16612 68 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 PRO0255Q9UI72 69 aa6.85□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 PKD1P98161 4303 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 A0A096LPF7 62 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 PKIGQ9Y2B9 76 aa6.84□□□□□ -1.31
VWA3A-208ENST00000568328 BRK1Q8WUW1 75 aa6.83□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 BPY2O14599 106 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 PRYO14603 147 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 KIAA0087Q14695 138 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.81□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 A0A0U1RQV1 116 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 IGLV6-57P01721 117 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 SEC61GP60059 68 aa6.8□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.79□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 RYR1P21817 5038 aa6.79□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 COX7BP24311 80 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 Q6ZQY7 126 aa6.78□□□□□ -1.32
VWA3A-208ENST00000568328 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 DIRC1Q969H9 104 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 OCR1Q9BZK8 76 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 KRTAP10-2P60368 255 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 PRR15Q8IV56 129 aa6.77□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 A0A087WTM6 91 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 A0A1B0GW54 56 aa6.76□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 GYPEP15421 78 aa6.75□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 IGKV4-1P06312 121 aa6.74□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 FAM229AH3BQW9 127 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 HSPG2P98160 4391 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 Q1T7F1 81 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 PKHD1P08F94 4074 aa6.73□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 PSCAO43653 123 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 Q6ZRU5 148 aa6.72□□□□□ -1.33
VWA3A-208ENST00000568328 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.2 ms