RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 UPK3BQ9BT76 320 aa8.14□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.13□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CASC10Q5T4H9 136 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SERP2Q8N6R1 65 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.12□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H3BQ85 93 aa8.12□□□□□ -1.11
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 TRAV10A0A0B4J240 114 aa8.11□□□□□ -1.11
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.11□□□□□ -1.11
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM168BA1KXE4 195 aa8.09□□□□□ -1.11
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.08□□□□□ -1.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.06□□□□□ -1.12
HOXC-AS3-204ENST00000567780 K7EIL1 84 aa8.05□□□□□ -1.12
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM236CP0DP71 79 aa8.03□□□□□ -1.12
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 RMI2Q96E14 147 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CXCL6P80162 114 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N377 158 aa8.02□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf195Q5TG92 126 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C20orf197Q8N268 126 aa8.01□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q6ZRX8 168 aa8□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q9BRP9 147 aa8□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.99□□□□□ -1.13
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8N9L7 120 aa7.99□□□□□ -1.13
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.93□□□□□ -1.14
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV4-1P06312 121 aa7.9□□□□□ -1.15
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 A0A1W2PNN7 141 aa7.88□□□□□ -1.15
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.87□□□□□ -1.15
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HOXC-AS3-204ENST00000567780 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.87□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C16orf90A8MZG2 172 aa7.86□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHTF8P0CG12 524 aa7.86□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 Q8NBF4 154 aa7.86□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 H7BZZ5 65 aa7.85□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 F8WEM9 126 aa7.85□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.85□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLKP1Q107X0 134 aa7.84□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 APLNQ9ULZ1 77 aa7.84□□□□□ -1.15
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.16
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