RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555617.5

ABCD4-222, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 4

Gene ABCD4, Length 542 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-222	ENST00000555617	SCGB3A1	Q96QR1	104 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.11	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617		A8MWP4	228 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617		Q75L30	129 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	C2orf88	Q9BSF0	95 aa		5.1	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BK	O60814	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	ATP5L	O75964	103 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BO	P23527	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BB	P33778	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BD	P58876	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC00310	P59036	64 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BC	P62807	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		5.09	□□□□□ -1.59
ABCD4-222	ENST00000555617	HSBP1	O75506	76 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	SERF1A	O75920	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	SEC11A	P67812	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	PMVK	Q15126	192 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	PMCHL1	Q16048	86 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	CST9L	Q9H4G1	147 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		5.08	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	VPREB1	P12018	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	ZC2HC1B	Q5TFG8	222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		5.07	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	HRES1	P13985	223 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	CKS1B	P61024	79 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	HERVK_113	P63121	156 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617		Q5VV11	94 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	LEPROTL1	O95214	131 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLC3	P0DOY3	106 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617		H7C2G1	150 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	NDUFA6	P56556	154 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617		F8VRH5	84 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617		H3BRM9	83 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	FABP4	P15090	132 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617		Q1RN00	199 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617		Q8IZM0	81 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	C11orf86	A6NJI1	115 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	PRSS2	P07478	247 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		5	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	PLN	P26678	52 aa		4.99	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	CXCL5	P42830	114 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A12	P80511	92 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617		H0Y8G0	127 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	DPM2	O94777	84 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A6	P06703	90 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	SPINK8	P0C7L1	97 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	PET117	Q6UWS5	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ABCD4-222	ENST00000555617	IGKC	P01834	107 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	C3orf79	P0CE67	100 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	LINC01545	Q5VT33	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	MUC5AC	P98088	5654 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	S100A2	P29034	98 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	SPRR1A	P35321	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	AKR1D1	P51857	326 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	KRTDAP	P60985	99 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	HERVK_113	P61574	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	LEPROT	O15243	131 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ABCD4-222	ENST00000555617	COX17	Q14061	63 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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