RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 TENM3Q9P273 2699 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 LINC01556Q5JQF7 62 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 DSCR8Q96T75 97 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 TRAV7A0A075B6U4 112 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 CXCL6P80162 114 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 F8WDY8 70 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 OXTP01178 125 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 MRAPQ8TCY5 172 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 HAMPP81172 84 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 SYCNQ0VAF6 134 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 CMYA5Q8N3K9 4069 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 CASC10Q5T4H9 136 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 C7orf33Q8WU49 177 aa3.84□□□□□ -1.79
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 FAM236CP0DP71 79 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 Q8N377 158 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 XP32Q5T750 250 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 SCXQ7RTU7 201 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 C20orf197Q8N268 126 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 C11orf45Q8TAV5 145 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 FAM168BA1KXE4 195 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 SPRR1AP35321 89 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 C4orf26Q17RF5 130 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00588Q9Y4M8 146 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 H7BZZ5 65 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 KLKP1Q107X0 134 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 Q5XG85 94 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 Q9BRP9 147 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 ANK2Q01484 3957 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 EPM2AB3EWF7 344 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 HRCT1Q6UXD1 115 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 ERC2-IT1O76042 136 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 IGKV4-1P06312 121 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 TM2D3Q9BRN9 247 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 Q6ZRX8 168 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1B0GW54 56 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1W2PNM2 257 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 Q8N9L7 120 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 DEFB105AQ8NG35 78 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 RMI2Q96E14 147 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 PRO0628Q9UI54 55 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 STAB1Q9NY15 2570 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-211ENST00000552253 F8P00451 2351 aa3.78□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 BPY2O14599 106 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 PRYO14603 147 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 SNURFQ9Y675 71 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 MAST4O15021 2626 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 NREPQ16612 68 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 OCR1Q9BZK8 76 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 C3orf84H3BNL1 204 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 SMIM29Q86T20 159 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 K7EIL1 84 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 SPRR4Q96PI1 79 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 Q8NBF4 154 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 A0A0U1RQV1 116 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 F8WEM9 126 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 C1orf137Q5JT78 98 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 NOTCH1P46531 2555 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 DSCR10P59022 87 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 A0A0G2JQZ4 141 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 A0A1W2PNN7 141 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 LINC00336Q6ZUF6 198 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 LCE6AA0A183 80 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 REG3GQ6UW15 175 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 A0A096LNI7 61 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRB-211ENST00000552253 BAHCC1Q9P281 2608 aa3.72□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms