RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541869.5

POLR1B-217, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene POLR1B, Length 5,059 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-217ENST00000541869 MT-ATP8P03928 68 aa6.78□□□□□ -1.32
POLR1B-217ENST00000541869 C15orf56Q8N910 161 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.77□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 VPREB1P12018 145 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZSA8 131 aa6.76□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 Q5VSD8 79 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 FAM168BA1KXE4 195 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GW54 56 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 IMUPQ9GZP8 106 aa6.75□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf92A6NGG3 77 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 PCOTHQ58A44 107 aa6.74□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 BRK1Q8WUW1 75 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.73□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 H0Y9P7 68 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 NDUFC1O43677 76 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 C5orf42Q9H799 3197 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.72□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.71□□□□□ -1.33
POLR1B-217ENST00000541869 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 CCDC179H3BU77 68 aa6.71□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 PCNTO95613 3336 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.7□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV6-57P01721 117 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 AKAP13Q12802 2813 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 UQCRQO14949 82 aa6.69□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.67□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.66□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 CXCL6P80162 114 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 MGAQ8IWI9 3026 aa6.65□□□□□ -1.34
POLR1B-217ENST00000541869 LAMA3Q16787 3333 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 DSPP15924 2871 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1W2PNN7 141 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 OXTP01178 125 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf195Q5TG92 126 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.64□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 SNURFQ9Y675 71 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 SPRR4Q96PI1 79 aa6.63□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.62□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 FLNCQ14315 2725 aa6.61□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 LINC00846Q9NV44 126 aa6.6□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 ACYP2P14621 99 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 DSCR10P59022 87 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 A6NED7 52 aa6.59□□□□□ -1.35
POLR1B-217ENST00000541869 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 LITAFQ99732 161 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 TENM4Q6N022 2769 aa6.58□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.57□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 A0A087WVE0 104 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 COX7CP15954 63 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZQT0 140 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 A8MWP4 228 aa6.56□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.55□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 ITPR2Q14571 2701 aa6.54□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 IGFL1Q6UW32 110 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 A0A0C4DFX4 3053 aa6.53□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 SMIM29Q86T20 159 aa6.52□□□□□ -1.36
POLR1B-217ENST00000541869 CD164Q04900 197 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GVX0 72 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 H3BPC8 53 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-1P60331 282 aa6.51□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 Q8N377 158 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.49□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 A0A1B0GU69 56 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP10-2P60368 255 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 REV3LO60673 3130 aa6.47□□□□□ -1.37
POLR1B-217ENST00000541869 PRO0628Q9UI54 55 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 BRCA2P51587 3418 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.46□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 ERC2-IT1O76042 136 aa6.45□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 Q6ZR54 194 aa6.44□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 HIVEP1P15822 2718 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 C4orf26Q17RF5 130 aa6.43□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
POLR1B-217ENST00000541869 LINC01554Q52M75 96 aa6.43□□□□□ -1.38
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