RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541576.5

THBS3-210, Transcript of thrombospondin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene THBS3, Length 3,200 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS3-210ENST00000541576 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.72□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 IGKV2D-28P01615 120 aa5.72□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 COX17Q14061 63 aa5.72□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 TMEM258P61165 79 aa5.72□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 PSCAO43653 123 aa5.71□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.71□□□□□ -1.49
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZRU5 148 aa5.7□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 C3orf84H3BNL1 204 aa5.7□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 M0R2N4 97 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 SYCNQ0VAF6 134 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 ORMDL1Q9P0S3 153 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 KMT2AQ03164 3969 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 LY6G6CO95867 125 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 Q5XG85 94 aa5.69□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 Q6JHZ5 121 aa5.68□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.68□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.68□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 FAM236CP0DP71 79 aa5.68□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 BRK1Q8WUW1 75 aa5.67□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 LINC00476Q8WZB0 136 aa5.67□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZR54 194 aa5.67□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 UBL5Q9BZL1 73 aa5.66□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.66□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.66□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.66□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.66□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 C14orf177Q52M58 125 aa5.65□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 Q8NDZ9 215 aa5.65□□□□□ -1.5
THBS3-210ENST00000541576 SEC61GP60059 68 aa5.65□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 F8WEM9 126 aa5.65□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 H0YGX0 51 aa5.65□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.65□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.65□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 DNAH2Q9P225 4427 aa5.65□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 LRCOL1A6NCL2 159 aa5.64□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 NDUFC2O95298 119 aa5.64□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZRP5 223 aa5.64□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 CCKP06307 115 aa5.63□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 C6orf99Q4VX62 202 aa5.63□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 TLX1NBP0CAT3 122 aa5.63□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 Q8N9L7 120 aa5.63□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.62□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 A0A087WTM6 91 aa5.6□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 Q8N814 137 aa5.6□□□□□ -1.51
THBS3-210ENST00000541576 H7BZZ5 65 aa5.59□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 VPREB1P12018 145 aa5.59□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 HYDINQ4G0P3 5121 aa5.58□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.58□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.58□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa5.58□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZQY7 126 aa5.57□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.57□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 PRO0628Q9UI54 55 aa5.57□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.57□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.57□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 C16orf90A8MZG2 172 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 NKAPP1Q8N9T2 125 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 A0A096LNI7 61 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 M0R378 163 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 IGLV6-57P01721 117 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 PRR4Q16378 134 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZVQ6 151 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.56□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa5.55□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 FAM168BA1KXE4 195 aa5.55□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.55□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.55□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.55□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 TNP2Q05952 138 aa5.54□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.54□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 RTL8CO15255 209 aa5.54□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 FAM229BQ4G0N7 80 aa5.54□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa5.53□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 LCE6AA0A183 80 aa5.53□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 C7orf33Q8WU49 177 aa5.53□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.53□□□□□ -1.52
THBS3-210ENST00000541576 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.52□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 CHTF8P0CG12 524 aa5.52□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 C1orf195Q5TG92 126 aa5.52□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.52□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 BPY2O14599 106 aa5.52□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 Q6ZQT0 140 aa5.52□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.51□□□□□ -1.53
THBS3-210ENST00000541576 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
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