RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541284.5

CNOT4-212, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene CNOT4, Length 3,563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-212ENST00000541284 J3KT08 172 aa6.24□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 M0R378 163 aa6.24□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 H3BQ85 93 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 CXCL6P80162 114 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 DSCR8Q96T75 97 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 PDE6GP18545 87 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 BCE1O60756 84 aa6.22□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.21□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.21□□□□□ -1.41
CNOT4-212ENST00000541284 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.21□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 EPM2AB3EWF7 344 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 FBN3Q75N90 2809 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 DNHD1Q96M86 4753 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 H7BZZ5 65 aa6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 HAMPP81172 84 aa6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 C20orf197Q8N268 126 aa6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 SCXQ7RTU7 201 aa6.18□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 KLKP1Q107X0 134 aa6.18□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 C7orf33Q8WU49 177 aa6.18□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 F8WDY8 70 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 Q8N377 158 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 CASC10Q5T4H9 136 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 Q5XG85 94 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 SYCNQ0VAF6 134 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 PKD1P98161 4303 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 KMT2AQ03164 3969 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 IGKV4-1P06312 121 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 Q9BRP9 147 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.15□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 SPRR1AP35321 89 aa6.15□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 TNP2Q05952 138 aa6.15□□□□□ -1.42
CNOT4-212ENST00000541284 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.15□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.15□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 FAM168BA1KXE4 195 aa6.15□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.14□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 Q8N9L7 120 aa6.14□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 RMI2Q96E14 147 aa6.13□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.13□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.13□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 Q6ZRX8 168 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 SNURFQ9Y675 71 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 A0A1W2PNM2 257 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 BPY2O14599 106 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 FAM236CP0DP71 79 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 STAB1Q9NY15 2570 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 OCR1Q9BZK8 76 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.1□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.1□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 ERC2-IT1O76042 136 aa6.1□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 NREPQ16612 68 aa6.1□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 C3orf84H3BNL1 204 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 C4orf26Q17RF5 130 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 PRYO14603 147 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-212ENST00000541284 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.08□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 MRAPQ8TCY5 172 aa6.08□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.08□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 F8WEM9 126 aa6.08□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 SMIM29Q86T20 159 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 SPRR4Q96PI1 79 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 A0A0U1RQV1 116 aa6.06□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 C5orf47Q569G3 176 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 NOTCH1P46531 2555 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 LCE6AA0A183 80 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 Q8NBF4 154 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 F8P00451 2351 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 DSCR10P59022 87 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 A0A1B0GW54 56 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 C1orf137Q5JT78 98 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 K7EIL1 84 aa6.03□□□□□ -1.44
CNOT4-212ENST00000541284 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-212ENST00000541284 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-212ENST00000541284 NDUFC1O43677 76 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-212ENST00000541284 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
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