RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527744.5

PUF60-211, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 2

Gene PUF60, Length 1,007 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-211ENST00000527744 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.88□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.87□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 C20orf202A1L168 122 aa6.87□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 ERC2-IT1O76042 136 aa6.87□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 HERVK_113P61574 105 aa6.87□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 SFTA2Q6UW10 78 aa6.87□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 DPM2O94777 84 aa6.86□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 LINC00310P59036 64 aa6.85□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 C11orf86A6NJI1 115 aa6.84□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 IGKCP01834 107 aa6.84□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 KRTDAPP60985 99 aa6.84□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 PET117Q6UWS5 81 aa6.84□□□□□ -1.31
PUF60-211ENST00000527744 B5MCH6 92 aa6.83□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.83□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 LINC00158P58513 81 aa6.83□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 LINC00587B1AMM8 73 aa6.82□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.82□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 Q9BRP9 147 aa6.82□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.81□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 TMEM223A0PJW6 202 aa6.81□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 NCR3O14931 201 aa6.81□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 IGLV6-57P01721 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 CFC1P0CG37 223 aa6.81□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 A0A0U1RRA0 63 aa6.8□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.8□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 C3orf79P0CE67 100 aa6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 HERV-K104P63124 156 aa6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 LIMD2Q9BT23 127 aa6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.79□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 LEPROTO15243 131 aa6.78□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 LINC01545Q5VT33 79 aa6.78□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.78□□□□□ -1.32
PUF60-211ENST00000527744 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.77□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 NMUP48645 174 aa6.77□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 Q6ZRX8 168 aa6.77□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.77□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.76□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.76□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 J3QQQ9 107 aa6.75□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 SMIM13P0DJ93 91 aa6.75□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 S100A12P80511 92 aa6.75□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.75□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 C5orf52A6NGY3 159 aa6.74□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 E9PLD3 99 aa6.74□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.74□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 SCGB1D1O95968 90 aa6.73□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.72□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PUF60-211ENST00000527744 DDTP30046 118 aa6.71□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.71□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 Q6Q795 121 aa6.7□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.69□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 ZNF815PA8K554 130 aa6.69□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 LCE2BO14633 110 aa6.69□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 ATOH7Q8N100 152 aa6.69□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 SPRR1BP22528 89 aa6.68□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.68□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 COPS9Q8WXC6 57 aa6.68□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.67□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 C1orf195Q5TG92 126 aa6.67□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.67□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.66□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 CD164Q04900 197 aa6.66□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 Q5XG85 94 aa6.66□□□□□ -1.34
PUF60-211ENST00000527744 A0A0J9YXY3 114 aa6.64□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 TIMM17BO60830 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.64□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.63□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 H7C2G1 150 aa6.63□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 MT2AP02795 61 aa6.63□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 VAMP8Q9BV40 100 aa6.63□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.62□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.62□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.62□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.61□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 Q6ZVH6 145 aa6.61□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 SMIM29Q86T20 159 aa6.6□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.6□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 NDUFC2O95298 119 aa6.59□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 IFITM1P13164 125 aa6.59□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 PCP2Q8IVA1 136 aa6.59□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 PRO1933Q9H354 126 aa6.59□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.59□□□□□ -1.35
PUF60-211ENST00000527744 MT1FP04733 61 aa6.58□□□□□ -1.36
PUF60-211ENST00000527744 NPC2P61916 151 aa6.58□□□□□ -1.36
PUF60-211ENST00000527744 SPATA45Q537H7 98 aa6.58□□□□□ -1.36
PUF60-211ENST00000527744 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.58□□□□□ -1.36
PUF60-211ENST00000527744 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.58□□□□□ -1.36
PUF60-211ENST00000527744 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.57□□□□□ -1.36
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