RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527027.1

PTPRU-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 619 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-210ENST00000527027 ZNF815PA8K554 130 aa9.09□□□□□ -0.95
PTPRU-210ENST00000527027 SPATA45Q537H7 98 aa9.09□□□□□ -0.95
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PTPRU-210ENST00000527027 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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PTPRU-210ENST00000527027 HIST1H4GQ99525 98 aa8.92□□□□□ -0.98
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PTPRU-210ENST00000527027 C9orf153Q5TBE3 101 aa8.82□□□□□ -1
PTPRU-210ENST00000527027 A4D1N5 150 aa8.81□□□□□ -1
PTPRU-210ENST00000527027 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
PTPRU-210ENST00000527027 PCOTHQ58A44 107 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-210ENST00000527027 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.79□□□□□ -1
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.78□□□□□ -1
PTPRU-210ENST00000527027 RAB37Q96AX2 223 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRU-210ENST00000527027 A6NDN8 102 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-210ENST00000527027 IGLV6-57P01721 117 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRU-210ENST00000527027 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PTPRU-210ENST00000527027 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRU-210ENST00000527027 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.74□□□□□ -1.01
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