RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526080.1

PTPRU-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRU, Length 424 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFC2O95298 119 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 CFC1P0CG37 223 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 SEC11CQ9BY50 192 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRU-209ENST00000526080 C1orf195Q5TG92 126 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 TMEM218A2RU14 115 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 H7C2G1 150 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 SMIM29Q86T20 159 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 PRO1933Q9H354 126 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRU-209ENST00000526080 LEPROTO15243 131 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 IFITM2Q01629 132 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 UQCC3Q6UW78 93 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 COMMD7Q86VX2 200 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 Q1RN00 199 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 CLLU1Q5K131 121 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 Q6Q795 121 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 J3QQQ9 107 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 LCE2BO14633 110 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 NMUP48645 174 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 NPC2P61916 151 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0G2JQZ4 141 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 MT2AP02795 61 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 AKR1D1P51857 326 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 RHEBQ15382 184 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 A0A0J9YXY3 114 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 PLNP26678 52 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 TAL2Q16559 108 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 Q75L30 129 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 SPANXCQ9NY87 97 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 COX7BP24311 80 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 NDUFA5Q16718 116 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 H0Y8G0 127 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 MT1FP04733 61 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 LITAFQ99732 161 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRU-209ENST00000526080 HERVK_113P61574 105 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 C6orf99Q4VX62 202 aa7.02□□□□□ -1.29
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PTPRU-209ENST00000526080 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.02□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 C20orf202A1L168 122 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 TCL1BO95988 128 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 HSBP1O75506 76 aa7□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 DPM2O94777 84 aa7□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 LEPROTL1O95214 131 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 IGKCP01834 107 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00310P59036 64 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 YPEL4Q96NS1 127 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRU-209ENST00000526080 E9PLD3 99 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 TIMM17BO60830 172 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 PCP2Q8IVA1 136 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 A0A1B0GWB2 263 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 SERF1AO75920 110 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP10-10P60014 251 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 HSPB8Q9UJY1 196 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRU-209ENST00000526080 NEBP20929 6669 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 A8MUU9 505 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 S100A1P23297 94 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 Q96NJ1 140 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 SNAPINO95295 136 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 APOC3P02656 99 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 FABP4P15090 132 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 SVBPQ8N300 66 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 A4D1N5 150 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 IGFL1Q6UW32 110 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 CLEC2BQ92478 149 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 LINC00846Q9NV44 126 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRU-209ENST00000526080 Q6JHZ5 121 aa6.85□□□□□ -1.31
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