RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000521941.1

CTNNA1-231, Transcript of catenin alpha 1, human

TSL 3

Gene CTNNA1, Length 224 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNNA1-231	ENST00000521941	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941		B5MCH6	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	C5orf52	A6NGY3	159 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q6ZRX8	168 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q9BRP9	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNNA1-231	ENST00000521941	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	PRR4	Q16378	134 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941		A6NDN8	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	IFITM1	P13164	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q6ZVH6	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	COX7B	P24311	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	MOBP	Q13875	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q8NBF4	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	C12orf57	Q99622	126 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	COX8A	P10176	69 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941		A4D1N5	150 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CTNNA1-231	ENST00000521941	LRP2	P98164	4655 aa		4.84	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	LPA	P08519	4548 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A1B0GWB2	263 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	TAL2	Q16559	108 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q1RN00	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941		H7C2G1	150 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	DLEU1	O43261	78 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	SLC25A20	O43772	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPINK1	P00995	79 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	VAMP3	Q15836	100 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	SPRR1B	P22528	89 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	CFC1	P0CG37	223 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	CTAG1A	P78358	180 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q6ZQY7	126 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	CEND1	Q8N111	149 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A0B4J2C4	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941		A6NJY4	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	FXYD2	P54710	66 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941		Q8N377	158 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941		F8WEM9	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CTNNA1-231	ENST00000521941	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65

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