RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517728.1

IGHVII-44-2-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-44-2 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-44-2, Length 250 nt, Biotype IG V pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C20orf202A1L168 122 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 E9PLD3 99 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NCR3O14931 201 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 AKR1D1P51857 326 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRLHP81277 87 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PET117Q6UWS5 81 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q8NDZ9 215 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CBY1Q9Y3M2 126 aa3.06□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa3.05□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NDUFC2O95298 119 aa3.05□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC01545Q5VT33 79 aa3.05□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HIGD2AQ9BW72 106 aa3.05□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3.05□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A087X002 238 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A0A0J9YXY3 114 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TIMM17BO60830 172 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DDTP30046 118 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPRR1AP35321 89 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KRTDAPP60985 99 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 CTAG1AP78358 180 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DAND5Q8N907 189 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LRP2P98164 4655 aa3.04□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF815PA8K554 130 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C3orf79P0CE67 100 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 S100A1P23297 94 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PRR4Q16378 134 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COPS9Q8WXC6 57 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPRR4Q96PI1 79 aa3.03□□□□□ -1.92
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TSPAN13O95857 204 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV6-57P01721 117 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPANXCQ9NY87 97 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.02□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 S100A2P29034 98 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 NPC2P61916 151 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SCGB1D4Q6XE38 83 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q6ZRX8 168 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPANXDQ9BXN6 97 aa3.01□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C5orf52A6NGY3 159 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 S100A6P06703 90 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LINC00483Q53H64 154 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q6ZVH6 145 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 OR13C6PQ8NH95 151 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 LITAFQ99732 161 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 PPDPFQ9H3Y8 114 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RNF213Q63HN8 5207 aa3□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HSBP1L1C9JCN9 74 aa2.99□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IFITM1P13164 125 aa2.99□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.99□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.99□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SPINK1P00995 79 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ATOH7Q8N100 152 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q8NBF4 154 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 Q9BRP9 147 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TTTY13Q9BZ97 58 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.98□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.97□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ERC2-IT1O76042 136 aa2.97□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 COX7BP24311 80 aa2.97□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 MOBPQ13875 183 aa2.97□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 A6NDN8 102 aa2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 TPRXLQ17RH7 258 aa2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C6orf99Q4VX62 202 aa2.96□□□□□ -1.94
IGHVII-44-2-201ENST00000517728 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms