RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512716.1

RASGEF1B-210, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3

Gene RASGEF1B, Length 516 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPANXCQ9NY87 97 aa14.07□□□□□ -0.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.06□□□□□ -0.16
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RASGEF1B-210ENST00000512716 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.06□□□□□ -0.16
RASGEF1B-210ENST00000512716 UBR4Q5T4S7 5183 aa14.05□□□□□ -0.16
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RASGEF1B-210ENST00000512716 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.02□□□□□ -0.17
RASGEF1B-210ENST00000512716 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.02□□□□□ -0.17
RASGEF1B-210ENST00000512716 CBY1Q9Y3M2 126 aa14.02□□□□□ -0.17
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRR4Q16378 134 aa14.01□□□□□ -0.17
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RASGEF1B-210ENST00000512716 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
RASGEF1B-210ENST00000512716 ERC2-IT1O76042 136 aa13.97□□□□□ -0.17
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RASGEF1B-210ENST00000512716 Q6ZVH6 145 aa13.93□□□□□ -0.18
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RASGEF1B-210ENST00000512716 C5orf52A6NGY3 159 aa13.86□□□□□ -0.19
RASGEF1B-210ENST00000512716 SCGB1D1O95968 90 aa13.86□□□□□ -0.19
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RASGEF1B-210ENST00000512716 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa13.85□□□□□ -0.19
RASGEF1B-210ENST00000512716 C6orf99Q4VX62 202 aa13.84□□□□□ -0.19
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RASGEF1B-210ENST00000512716 MOBPQ13875 183 aa13.83□□□□□ -0.2
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RASGEF1B-210ENST00000512716 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa13.82□□□□□ -0.2
RASGEF1B-210ENST00000512716 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa13.82□□□□□ -0.2
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RASGEF1B-210ENST00000512716 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa13.77□□□□□ -0.21
RASGEF1B-210ENST00000512716 C9orf153Q5TBE3 101 aa13.76□□□□□ -0.21
RASGEF1B-210ENST00000512716 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa13.75□□□□□ -0.21
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPINK1P00995 79 aa13.74□□□□□ -0.21
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RASGEF1B-210ENST00000512716 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa13.71□□□□□ -0.21
RASGEF1B-210ENST00000512716 COX8AP10176 69 aa13.71□□□□□ -0.21
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC25A34Q6PIV7 304 aa13.71□□□□□ -0.21
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RASGEF1B-210ENST00000512716 TAL2Q16559 108 aa13.68□□□□□ -0.22
RASGEF1B-210ENST00000512716 DEFB105AQ8NG35 78 aa13.67□□□□□ -0.22
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RASGEF1B-210ENST00000512716 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.65□□□□□ -0.22
RASGEF1B-210ENST00000512716 RNF213Q63HN8 5207 aa13.65□□□□□ -0.22
RASGEF1B-210ENST00000512716 DLEU1O43261 78 aa13.64□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 RPS29P62273 56 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 TPRXLQ17RH7 258 aa13.64□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP13.64□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 SPATA45Q537H7 98 aa13.63□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.62□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 C14orf144Q96I85 54 aa13.62□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 VAMP8Q9BV40 100 aa13.62□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.62□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 CDIP1Q9H305 208 aa13.61□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 VAMP3Q15836 100 aa13.6□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q1RN00 199 aa13.6□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 C12orf57Q99622 126 aa13.6□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q8N377 158 aa13.59□□□□□ -0.23
RASGEF1B-210ENST00000512716 SLC25A20O43772 301 aa13.57□□□□□ -0.24
RASGEF1B-210ENST00000512716 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.56□□□□□ -0.24
RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
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RASGEF1B-210ENST00000512716 LINC00575Q6W349 94 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 SMIM29Q86T20 159 aa13.52□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 PRO1933Q9H354 126 aa13.51□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 C2orf91Q6ZV80 131 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 LIMD2Q9BT23 127 aa13.49□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 hADV29S1A0JD25 119 aa13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFC1BP0CG36 223 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 CFC1P0CG37 223 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 RAB37Q96AX2 223 aa13.47□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 H7C2G1 150 aa13.46□□□□□ -0.25
RASGEF1B-210ENST00000512716 PYY3Q5JQD4 70 aa13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-210ENST00000512716 Q6ZQY7 126 aa13.45□□□□□ -0.26
RASGEF1B-210ENST00000512716 CD164Q04900 197 aa13.44□□□□□ -0.26
RASGEF1B-210ENST00000512716 A0A0B4J2C4 111 aa13.42□□□□□ -0.26
RASGEF1B-210ENST00000512716 CEND1Q8N111 149 aa13.42□□□□□ -0.26
RASGEF1B-210ENST00000512716 F8WEM9 126 aa13.41□□□□□ -0.26
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