RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512553.5

ITGA3-213, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-213ENST00000512553 SPANXCQ9NY87 97 aa5.39□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BKO60814 126 aa5.38□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BJP06899 126 aa5.38□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BOP23527 126 aa5.38□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BBP33778 126 aa5.38□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BDP58876 126 aa5.38□□□□□ -1.55
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ITGA3-213ENST00000512553 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
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ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BHQ93079 126 aa5.38□□□□□ -1.55
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ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BMQ99879 126 aa5.38□□□□□ -1.55
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ITGA3-213ENST00000512553 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.36□□□□□ -1.55
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ITGA3-213ENST00000512553 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.35□□□□□ -1.55
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ITGA3-213ENST00000512553 ERC2-IT1O76042 136 aa5.34□□□□□ -1.55
ITGA3-213ENST00000512553 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.33□□□□□ -1.56
ITGA3-213ENST00000512553 LITAFQ99732 161 aa5.33□□□□□ -1.56
ITGA3-213ENST00000512553 LIMD2Q9BT23 127 aa5.33□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 Q6ZVH6 145 aa5.32□□□□□ -1.56
ITGA3-213ENST00000512553 Q8N377 158 aa5.32□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 IFITM1P13164 125 aa5.31□□□□□ -1.56
ITGA3-213ENST00000512553 SPRR1BP22528 89 aa5.31□□□□□ -1.56
ITGA3-213ENST00000512553 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.31□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 COX7BP24311 80 aa5.3□□□□□ -1.56
ITGA3-213ENST00000512553 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.29□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.28□□□□□ -1.56
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ITGA3-213ENST00000512553 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa5.26□□□□□ -1.57
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ITGA3-213ENST00000512553 A6NDN8 102 aa5.25□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 PRO1933Q9H354 126 aa5.25□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.25□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 HSBP1L1C9JCN9 74 aa5.24□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 ANKRD39Q53RE8 183 aa5.24□□□□□ -1.57
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ITGA3-213ENST00000512553 H7C2G1 150 aa5.23□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 S100A2P29034 98 aa5.23□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 VAMP3Q15836 100 aa5.23□□□□□ -1.57
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ITGA3-213ENST00000512553 Q1RN00 199 aa5.22□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.22□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 ATOH7Q8N100 152 aa5.22□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.22□□□□□ -1.57
ITGA3-213ENST00000512553 F8WEM9 126 aa5.21□□□□□ -1.58
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ITGA3-213ENST00000512553 Q5XG85 94 aa5.21□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 PCP2Q8IVA1 136 aa5.21□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.2□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 S100A6P06703 90 aa5.19□□□□□ -1.58
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ITGA3-213ENST00000512553 S100A1P23297 94 aa5.18□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.18□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 SMIM11BQ8TCY0 68 aa5.18□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 SMIM29Q86T20 159 aa5.17□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.17□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 Q6JHZ5 121 aa5.16□□□□□ -1.58
ITGA3-213ENST00000512553 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa5.16□□□□□ -1.58
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ITGA3-213ENST00000512553 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa5.15□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 PPDPFLQ8WWR9 84 aa5.15□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 hADV29S1A0JD25 119 aa5.14□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 C9orf92A6NGG3 77 aa5.14□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 LINC00575Q6W349 94 aa5.14□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 SCGB1D1O95968 90 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 C1orf195Q5TG92 126 aa5.13□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
ITGA3-213ENST00000512553 CLEC2BQ92478 149 aa5.13□□□□□ -1.59
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