RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507771.5

ITGA3-210, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 3

Gene ITGA3, Length 399 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
ITGA3-210ENST00000507771 CEND1Q8N111 149 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA3-210ENST00000507771 PRO1933Q9H354 126 aa6.84□□□□□ -1.31
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF861PO60384 105 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 DIRC1Q969H9 104 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 RAB37Q96AX2 223 aa6.83□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.82□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 SPRR1AP35321 89 aa6.81□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 H0Y9J4 135 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 PRLHP81277 87 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.8□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 A0A0B4J2C4 111 aa6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 M0R143 59 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 CFC1BP0CG36 223 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 CFC1P0CG37 223 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 VAMP3Q15836 100 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.78□□□□□ -1.32
ITGA3-210ENST00000507771 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 B5MCH6 92 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 COX7BP24311 80 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 FXYD2P54710 66 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 Q1RN00 199 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 C6orf99Q4VX62 202 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 Q6ZRX8 168 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.77□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1B0GWB2 263 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 CTAG1AP78358 180 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 H7C2G1 150 aa6.75□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 SLC25A20O43772 301 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.74□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 SNCGO76070 127 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 OXTP01178 125 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.73□□□□□ -1.33
ITGA3-210ENST00000507771 Q9BRP9 147 aa6.71□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 H0YGX0 51 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 K7ERJ3 54 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 PSMB2P49721 201 aa6.7□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 J3QL48 77 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 COX6CP09669 75 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 LINC01600Q96MT4 127 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 SPRR4Q96PI1 79 aa6.69□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 CRYGAP11844 174 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 BATFQ16520 125 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 MYCBP2O75592 4640 aa6.68□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 ERC2-IT1O76042 136 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.67□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 hADV29S1A0JD25 119 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00575Q6W349 94 aa6.66□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 TSPAN13O95857 204 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.65□□□□□ -1.34
ITGA3-210ENST00000507771 TRIAP1O43715 76 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 GHRHP01286 108 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.64□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 A0A1B0GX51 115 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 LINC00483Q53H64 154 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.63□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 DNAL4O96015 105 aa6.62□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.62□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.62□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.61□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.61□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 Q6ZQY7 126 aa6.61□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 A0A087X002 238 aa6.6□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 SPRR1BP22528 89 aa6.6□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP10-8P60410 259 aa6.6□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.59□□□□□ -1.35
ITGA3-210ENST00000507771 F8WEM9 126 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGA3-210ENST00000507771 CLEC2BQ92478 149 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGA3-210ENST00000507771 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGA3-210ENST00000507771 TNXBP22105 4242 aa6.58□□□□□ -1.36
ITGA3-210ENST00000507771 H3BQ85 93 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGA3-210ENST00000507771 MT1HL1P0DM35 61 aa6.57□□□□□ -1.36
ITGA3-210ENST00000507771 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms