RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496569.1

HDLBP-246, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-246ENST00000496569 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 MUC17Q685J3 4493 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 Q6ZRX8 168 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 Q8NBF4 154 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.01□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 S100A12P80511 92 aa7□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 MOBPQ13875 183 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00483Q53H64 154 aa6.99□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.98□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.98□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 TIMM17BO60830 172 aa6.97□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 SPANXCQ9NY87 97 aa6.97□□□□□ -1.29
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 PCP2Q8IVA1 136 aa6.96□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 C20orf202A1L168 122 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.94□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.93□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.92□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 TPRXLQ17RH7 258 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 C6orf99Q4VX62 202 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 CDIP1Q9H305 208 aa6.91□□□□□ -1.3
HDLBP-246ENST00000496569 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.89□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 SPINK1P00995 79 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 COX7BP24311 80 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.88□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 S100A2P29034 98 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 CTAG1AP78358 180 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 Q8N377 158 aa6.87□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 A6NDN8 102 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 S100A1P23297 94 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.86□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 Q1RN00 199 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.85□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 IFITM1P13164 125 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 SPRR1BP22528 89 aa6.84□□□□□ -1.31
HDLBP-246ENST00000496569 S100A6P06703 90 aa6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 A0A0G2JQZ4 141 aa6.82□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 TAL2Q16559 108 aa6.82□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.82□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 Q6ZVH6 145 aa6.81□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 A0A1B0GWB2 263 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 C5orf52A6NGY3 159 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 SLC25A20O43772 301 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 AKR1D1P51857 326 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 COPS9Q8WXC6 57 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.8□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 A4D1N5 150 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 SCGB1D1O95968 90 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 SMIM29Q86T20 159 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 C12orf57Q99622 126 aa6.79□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 H7C2G1 150 aa6.78□□□□□ -1.32
HDLBP-246ENST00000496569 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.77□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.76□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 A0A0U1RQV1 116 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 XP32Q5T750 250 aa6.74□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 C9orf92A6NGG3 77 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 COX8AP10176 69 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 C14orf144Q96I85 54 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 HIST1H4GQ99525 98 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 LIMD2Q9BT23 127 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 PRO1933Q9H354 126 aa6.73□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 PAM16Q9Y3D7 125 aa6.72□□□□□ -1.33
HDLBP-246ENST00000496569 LINC00575Q6W349 94 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 Q6ZQY7 126 aa6.71□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 SPATA45Q537H7 98 aa6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 CD164Q04900 197 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.68□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 hADV29S1A0JD25 119 aa6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
HDLBP-246ENST00000496569 VAMP3Q15836 100 aa6.67□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms