RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496549.5

CRNKL1-205, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, human

TSL 1 (best)

Gene CRNKL1, Length 4,093 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRNKL1-205	ENST00000496549	MTOR	P42345	2549 aa		5.54	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.54	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	HTN3	P15516	51 aa		5.54	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRO0255	Q9UI72	69 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	TACC2	O95359	2948 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITPR2	Q14571	2701 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549		H0Y9J4	135 aa		5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.53	□□□□□ -1.52
CRNKL1-205	ENST00000496549		K7EQZ3	153 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00313	P59037	77 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	MOBP	Q13875	183 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	PCOTH	Q58A44	107 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8NBF4	154 aa		5.52	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	LMO4	P61968	165 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV4-59	P01825	116 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	MSMB	P08118	114 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MU10	97 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	KIAA0087	Q14695	138 aa		5.51	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549		B4DSR2	109 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549		J3QKU1	62 aa		5.5	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		5.49	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	CCL19	Q99731	98 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		5.48	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACAN	P16112	2415 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	LRBA	P50851	2863 aa		5.47	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.46	□□□□□ -1.53
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBXL19-AS1	Q494R0	122 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.46	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A087WSZ3	146 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		5.45	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	LCE6A	A0A183	80 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.44	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	JMJD1C	Q15652	2540 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1B0GU69	56 aa		5.43	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	5.43	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	F8	P00451	2351 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		5.42	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSCR10	P59022	87 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549		A0A1W2PNM2	257 aa		5.41	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGKV2D-24	A0A075B6R9	120 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPINK7	P58062	85 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	DSCR9	P59020	149 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8N377	158 aa		5.4	□□□□□ -1.54
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		5.39	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	LELP1	Q5T871	98 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	CR1	P17927	2039 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	APC	P25054	2843 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZNF702P	Q9H963	129 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	ITPR3	Q14573	2671 aa		5.38	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	UQCR11	O14957	56 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	C7orf33	Q8WU49	177 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	ACYP2	P14621	99 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q6ZRX8	168 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		5.37	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8NAQ8	132 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549		Q8NDZ9	215 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPRR4	Q96PI1	79 aa		5.36	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549		A8MWP4	228 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	FBN2	P35556	2912 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	FN1	P02751	2386 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		5.35	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	ZFHX3	Q15911	3703 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	IGLV1-51	P01701	117 aa		5.34	□□□□□ -1.55
CRNKL1-205	ENST00000496549	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		5.34	□□□□□ -1.55

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.5 ms