RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492657.5

PRAME-213, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRAME, Length 2,831 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZRP5 223 aa8.46□□□□□ -1.05
PRAME-213ENST00000492657 TENM2Q9NT68 2774 aa8.46□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 K7EIL1 84 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 CASC10Q5T4H9 136 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.45□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 FAM236CP0DP71 79 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZQT0 140 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 DIRC1Q969H9 104 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 H7BZZ5 65 aa8.44□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 SYCNQ0VAF6 134 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 SEC61GP60059 68 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.43□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 LYSTQ99698 3801 aa8.42□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 TM2D3Q9BRN9 247 aa8.42□□□□□ -1.06
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PRAME-213ENST00000492657 COX7BP24311 80 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 Q8N9L7 120 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 F8WEM9 126 aa8.41□□□□□ -1.06
PRAME-213ENST00000492657 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
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PRAME-213ENST00000492657 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZVQ6 151 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.39□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 FAM168BA1KXE4 195 aa8.36□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 C7orf33Q8WU49 177 aa8.35□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 A0A0U1RQV1 116 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 PDE6GP18545 87 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.34□□□□□ -1.07
PRAME-213ENST00000492657 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.33□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 H3BQ85 93 aa8.32□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
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PRAME-213ENST00000492657 DEFB105AQ8NG35 78 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 BRK1Q8WUW1 75 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 BPY2O14599 106 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 KLKP1Q107X0 134 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 CXCL6P80162 114 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-213ENST00000492657 MDFIQ99750 246 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 C3orf84H3BNL1 204 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
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PRAME-213ENST00000492657 PRO0628Q9UI54 55 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 EPM2AB3EWF7 344 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 Q9BRP9 147 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 Q8N377 158 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.21□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 Q6ZRX8 168 aa8.21□□□□□ -1.09
PRAME-213ENST00000492657 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 BCE1O60756 84 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 ERC2-IT1O76042 136 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 APLNQ9ULZ1 77 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 PRYO14603 147 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 SPRR1AP35321 89 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 A0A096LNI7 61 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 PSCAO43653 123 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 A0A1W2PNN7 141 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 PRR4Q16378 134 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 IGKV4-1P06312 121 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 UBE2BP63146 152 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-213ENST00000492657 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
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